Protein–RNA interactions for Protein: P06801

Me1, NADP-dependent malic enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me1P06801 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Me1P06801 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Me1P06801 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Me1P06801 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Me1P06801 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Me1P06801 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Me1P06801 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Me1P06801 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Me1P06801 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Me1P06801 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Me1P06801 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Me1P06801 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Me1P06801 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Me1P06801 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Me1P06801 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Me1P06801 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Me1P06801 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Me1P06801 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Me1P06801 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Me1P06801 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Me1P06801 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Me1P06801 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Me1P06801 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Me1P06801 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Me1P06801 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Me1P06801 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Me1P06801 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Me1P06801 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Me1P06801 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Me1P06801 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Me1P06801 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Me1P06801 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Me1P06801 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Me1P06801 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Me1P06801 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Me1P06801 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Me1P06801 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Me1P06801 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Me1P06801 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Me1P06801 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Me1P06801 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Me1P06801 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Me1P06801 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Me1P06801 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Me1P06801 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Me1P06801 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Me1P06801 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Me1P06801 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Me1P06801 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Me1P06801 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Me1P06801 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Me1P06801 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Me1P06801 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Me1P06801 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Me1P06801 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Me1P06801 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Me1P06801 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Me1P06801 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Me1P06801 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Me1P06801 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Me1P06801 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Me1P06801 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Me1P06801 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Me1P06801 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Me1P06801 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Me1P06801 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Me1P06801 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Me1P06801 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Me1P06801 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Me1P06801 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Me1P06801 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Me1P06801 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Me1P06801 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Me1P06801 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Me1P06801 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Me1P06801 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Me1P06801 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Me1P06801 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Me1P06801 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Me1P06801 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Me1P06801 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Me1P06801 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Me1P06801 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Me1P06801 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Me1P06801 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Me1P06801 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Me1P06801 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Me1P06801 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Me1P06801 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Me1P06801 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Me1P06801 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Me1P06801 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Me1P06801 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Me1P06801 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Me1P06801 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Me1P06801 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Me1P06801 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Me1P06801 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Me1P06801 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Me1P06801 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms