Protein–RNA interactions for Protein: P06329

Ig heavy chain V region AC38 15.3, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06329 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06329 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06329 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06329 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06329 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06329 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06329 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06329 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06329 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06329 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06329 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06329 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06329 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06329 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06329 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06329 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06329 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06329 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06329 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06329 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06329 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P06329 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06329 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06329 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06329 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06329 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06329 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06329 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06329 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06329 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06329 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06329 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06329 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06329 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06329 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06329 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06329 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06329 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06329 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06329 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06329 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P06329 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P06329 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P06329 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P06329 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P06329 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P06329 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P06329 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P06329 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P06329 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06329 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06329 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06329 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
P06329 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P06329 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06329 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06329 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06329 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06329 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06329 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06329 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06329 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06329 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06329 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06329 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P06329 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06329 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06329 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06329 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06329 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06329 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P06329 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06329 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06329 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06329 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06329 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06329 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06329 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06329 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06329 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06329 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06329 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06329 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06329 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06329 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P06329 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06329 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P06329 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P06329 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P06329 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P06329 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P06329 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P06329 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P06329 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P06329 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P06329 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P06329 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P06329 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
P06329 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P06329 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.4 ms