Protein–RNA interactions for Protein: P04342

Crygd, Gamma-crystallin D, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrygdP04342 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CrygdP04342 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CrygdP04342 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CrygdP04342 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CrygdP04342 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CrygdP04342 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CrygdP04342 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CrygdP04342 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CrygdP04342 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CrygdP04342 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CrygdP04342 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CrygdP04342 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CrygdP04342 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CrygdP04342 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CrygdP04342 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CrygdP04342 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CrygdP04342 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CrygdP04342 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CrygdP04342 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CrygdP04342 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CrygdP04342 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CrygdP04342 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CrygdP04342 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CrygdP04342 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CrygdP04342 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CrygdP04342 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CrygdP04342 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CrygdP04342 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CrygdP04342 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CrygdP04342 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CrygdP04342 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CrygdP04342 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CrygdP04342 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CrygdP04342 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CrygdP04342 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CrygdP04342 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CrygdP04342 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CrygdP04342 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CrygdP04342 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CrygdP04342 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CrygdP04342 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CrygdP04342 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CrygdP04342 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CrygdP04342 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CrygdP04342 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CrygdP04342 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CrygdP04342 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CrygdP04342 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CrygdP04342 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CrygdP04342 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CrygdP04342 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CrygdP04342 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CrygdP04342 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CrygdP04342 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CrygdP04342 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CrygdP04342 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CrygdP04342 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CrygdP04342 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CrygdP04342 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CrygdP04342 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CrygdP04342 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CrygdP04342 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CrygdP04342 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CrygdP04342 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CrygdP04342 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CrygdP04342 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CrygdP04342 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CrygdP04342 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CrygdP04342 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CrygdP04342 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CrygdP04342 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CrygdP04342 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CrygdP04342 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CrygdP04342 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CrygdP04342 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CrygdP04342 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CrygdP04342 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CrygdP04342 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CrygdP04342 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CrygdP04342 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CrygdP04342 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CrygdP04342 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CrygdP04342 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CrygdP04342 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CrygdP04342 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CrygdP04342 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CrygdP04342 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CrygdP04342 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CrygdP04342 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CrygdP04342 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CrygdP04342 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CrygdP04342 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CrygdP04342 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CrygdP04342 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CrygdP04342 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CrygdP04342 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CrygdP04342 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CrygdP04342 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CrygdP04342 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CrygdP04342 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms