Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2-Eb1P04230 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2-Eb1P04230 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2-Eb1P04230 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2-Eb1P04230 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2-Eb1P04230 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2-Eb1P04230 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2-Eb1P04230 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2-Eb1P04230 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2-Eb1P04230 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2-Eb1P04230 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2-Eb1P04230 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2-Eb1P04230 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2-Eb1P04230 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2-Eb1P04230 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2-Eb1P04230 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2-Eb1P04230 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2-Eb1P04230 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2-Eb1P04230 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2-Eb1P04230 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
H2-Eb1P04230 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2-Eb1P04230 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2-Eb1P04230 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2-Eb1P04230 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2-Eb1P04230 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2-Eb1P04230 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2-Eb1P04230 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2-Eb1P04230 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2-Eb1P04230 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2-Eb1P04230 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2-Eb1P04230 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2-Eb1P04230 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2-Eb1P04230 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2-Eb1P04230 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
H2-Eb1P04230 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
H2-Eb1P04230 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2-Eb1P04230 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2-Eb1P04230 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2-Eb1P04230 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2-Eb1P04230 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2-Eb1P04230 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2-Eb1P04230 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2-Eb1P04230 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2-Eb1P04230 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2-Eb1P04230 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2-Eb1P04230 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2-Eb1P04230 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2-Eb1P04230 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2-Eb1P04230 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2-Eb1P04230 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2-Eb1P04230 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2-Eb1P04230 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2-Eb1P04230 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2-Eb1P04230 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2-Eb1P04230 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
H2-Eb1P04230 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2-Eb1P04230 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2-Eb1P04230 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2-Eb1P04230 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
H2-Eb1P04230 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2-Eb1P04230 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2-Eb1P04230 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2-Eb1P04230 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2-Eb1P04230 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2-Eb1P04230 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2-Eb1P04230 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2-Eb1P04230 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2-Eb1P04230 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2-Eb1P04230 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2-Eb1P04230 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2-Eb1P04230 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
H2-Eb1P04230 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2-Eb1P04230 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2-Eb1P04230 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2-Eb1P04230 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2-Eb1P04230 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2-Eb1P04230 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2-Eb1P04230 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2-Eb1P04230 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2-Eb1P04230 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2-Eb1P04230 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2-Eb1P04230 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2-Eb1P04230 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2-Eb1P04230 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
H2-Eb1P04230 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2-Eb1P04230 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2-Eb1P04230 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2-Eb1P04230 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2-Eb1P04230 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2-Eb1P04230 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
H2-Eb1P04230 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2-Eb1P04230 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2-Eb1P04230 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2-Eb1P04230 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2-Eb1P04230 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2-Eb1P04230 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2-Eb1P04230 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2-Eb1P04230 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2-Eb1P04230 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2-Eb1P04230 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms