Protein–RNA interactions for Protein: P04104

Krt1, Keratin, type II cytoskeletal 1, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt1P04104 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt1P04104 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt1P04104 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt1P04104 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt1P04104 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt1P04104 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt1P04104 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt1P04104 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt1P04104 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt1P04104 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt1P04104 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt1P04104 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt1P04104 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt1P04104 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt1P04104 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt1P04104 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt1P04104 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt1P04104 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt1P04104 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt1P04104 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt1P04104 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt1P04104 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt1P04104 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt1P04104 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt1P04104 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt1P04104 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt1P04104 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt1P04104 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt1P04104 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt1P04104 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt1P04104 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt1P04104 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt1P04104 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt1P04104 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt1P04104 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt1P04104 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt1P04104 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt1P04104 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt1P04104 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt1P04104 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt1P04104 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt1P04104 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt1P04104 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt1P04104 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt1P04104 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt1P04104 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt1P04104 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt1P04104 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt1P04104 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt1P04104 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt1P04104 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt1P04104 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt1P04104 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt1P04104 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt1P04104 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt1P04104 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt1P04104 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt1P04104 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt1P04104 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt1P04104 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt1P04104 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt1P04104 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt1P04104 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt1P04104 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt1P04104 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt1P04104 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt1P04104 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt1P04104 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt1P04104 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt1P04104 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt1P04104 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt1P04104 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt1P04104 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt1P04104 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt1P04104 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt1P04104 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt1P04104 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt1P04104 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt1P04104 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Krt1P04104 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Krt1P04104 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt1P04104 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt1P04104 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt1P04104 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt1P04104 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt1P04104 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt1P04104 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt1P04104 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt1P04104 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt1P04104 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt1P04104 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt1P04104 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt1P04104 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt1P04104 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt1P04104 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt1P04104 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt1P04104 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt1P04104 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt1P04104 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt1P04104 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms