Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,12■■□□□ 1,45
P01648 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24,12■■□□□ 1,45
P01648 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
P01648 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24,1■■□□□ 1,45
P01648 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24,1■■□□□ 1,45
P01648 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,1■■□□□ 1,45
P01648 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24,09■■□□□ 1,45
P01648 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
P01648 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,45
P01648 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,45
P01648 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,44
P01648 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,44
P01648 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24,07■■□□□ 1,44
P01648 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,07■■□□□ 1,44
P01648 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
P01648 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24,06■■□□□ 1,44
P01648 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24,06■■□□□ 1,44
P01648 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24,06■■□□□ 1,44
P01648 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24,06■■□□□ 1,44
P01648 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24,06■■□□□ 1,44
P01648 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24,06■■□□□ 1,44
P01648 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24,04■■□□□ 1,44
P01648 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
P01648 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
P01648 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
P01648 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
P01648 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24,02■■□□□ 1,44
P01648 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,01■■□□□ 1,43
P01648 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24,01■■□□□ 1,43
P01648 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1,43
P01648 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
P01648 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1,43
P01648 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
P01648 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,99■■□□□ 1,43
P01648 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,98■■□□□ 1,43
P01648 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,98■■□□□ 1,43
P01648 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,97■■□□□ 1,43
P01648 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,96■■□□□ 1,43
P01648 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,96■■□□□ 1,43
P01648 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23,96■■□□□ 1,43
P01648 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23,95■■□□□ 1,43
P01648 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
P01648 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,94■■□□□ 1,42
P01648 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
P01648 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
P01648 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23,93■■□□□ 1,42
P01648 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23,92■■□□□ 1,42
P01648 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
P01648 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
P01648 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23,91■■□□□ 1,42
P01648 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
P01648 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
P01648 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,9■■□□□ 1,42
P01648 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,9■■□□□ 1,42
P01648 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23,9■■□□□ 1,42
P01648 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23,9■■□□□ 1,42
P01648 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,9■■□□□ 1,42
P01648 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,89■■□□□ 1,42
P01648 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,89■■□□□ 1,42
P01648 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,89■■□□□ 1,42
P01648 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,89■■□□□ 1,41
P01648 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,89■■□□□ 1,41
P01648 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23,88■■□□□ 1,41
P01648 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
P01648 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
P01648 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23,88■■□□□ 1,41
P01648 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23,88■■□□□ 1,41
P01648 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,87■■□□□ 1,41
P01648 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23,87■■□□□ 1,41
P01648 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23,87■■□□□ 1,41
P01648 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,87■■□□□ 1,41
P01648 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23,87■■□□□ 1,41
P01648 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23,87■■□□□ 1,41
P01648 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23,86■■□□□ 1,41
P01648 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,86■■□□□ 1,41
P01648 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
P01648 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
P01648 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23,85■■□□□ 1,41
P01648 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
P01648 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23,84■■□□□ 1,41
P01648 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23,84■■□□□ 1,41
P01648 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
P01648 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23,83■■□□□ 1,41
P01648 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,83■■□□□ 1,41
P01648 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
P01648 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
P01648 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
P01648 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
P01648 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,82■■□□□ 1,4
P01648 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23,82■■□□□ 1,4
P01648 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
P01648 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
P01648 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
P01648 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
P01648 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23,8■■□□□ 1,4
P01648 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
P01648 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,79■■□□□ 1,4
P01648 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,79■■□□□ 1,4
P01648 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
P01648 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,9 ms