Protein–RNA interactions for Protein: O89116

Vti1a, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1aO89116 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vti1aO89116 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vti1aO89116 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vti1aO89116 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vti1aO89116 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vti1aO89116 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vti1aO89116 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Vti1aO89116 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vti1aO89116 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vti1aO89116 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vti1aO89116 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vti1aO89116 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vti1aO89116 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vti1aO89116 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vti1aO89116 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Vti1aO89116 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vti1aO89116 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vti1aO89116 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vti1aO89116 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Vti1aO89116 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vti1aO89116 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vti1aO89116 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vti1aO89116 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vti1aO89116 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Vti1aO89116 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vti1aO89116 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vti1aO89116 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vti1aO89116 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vti1aO89116 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vti1aO89116 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vti1aO89116 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vti1aO89116 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vti1aO89116 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vti1aO89116 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Vti1aO89116 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vti1aO89116 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vti1aO89116 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vti1aO89116 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vti1aO89116 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vti1aO89116 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vti1aO89116 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vti1aO89116 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vti1aO89116 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vti1aO89116 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vti1aO89116 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vti1aO89116 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Vti1aO89116 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vti1aO89116 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vti1aO89116 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vti1aO89116 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vti1aO89116 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vti1aO89116 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vti1aO89116 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vti1aO89116 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vti1aO89116 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vti1aO89116 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vti1aO89116 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vti1aO89116 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vti1aO89116 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vti1aO89116 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vti1aO89116 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vti1aO89116 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vti1aO89116 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vti1aO89116 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vti1aO89116 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vti1aO89116 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Vti1aO89116 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Vti1aO89116 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vti1aO89116 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Vti1aO89116 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Vti1aO89116 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vti1aO89116 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vti1aO89116 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vti1aO89116 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vti1aO89116 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vti1aO89116 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vti1aO89116 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vti1aO89116 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vti1aO89116 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vti1aO89116 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vti1aO89116 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vti1aO89116 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vti1aO89116 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vti1aO89116 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Vti1aO89116 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vti1aO89116 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vti1aO89116 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vti1aO89116 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vti1aO89116 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vti1aO89116 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vti1aO89116 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vti1aO89116 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vti1aO89116 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vti1aO89116 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vti1aO89116 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vti1aO89116 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Vti1aO89116 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vti1aO89116 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vti1aO89116 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Vti1aO89116 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms