Protein–RNA interactions for Protein: O88958

Gnpda1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda1O88958 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gnpda1O88958 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gnpda1O88958 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gnpda1O88958 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gnpda1O88958 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gnpda1O88958 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gnpda1O88958 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gnpda1O88958 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gnpda1O88958 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gnpda1O88958 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gnpda1O88958 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gnpda1O88958 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gnpda1O88958 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gnpda1O88958 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gnpda1O88958 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gnpda1O88958 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gnpda1O88958 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gnpda1O88958 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gnpda1O88958 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gnpda1O88958 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gnpda1O88958 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gnpda1O88958 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gnpda1O88958 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gnpda1O88958 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gnpda1O88958 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gnpda1O88958 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gnpda1O88958 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gnpda1O88958 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gnpda1O88958 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gnpda1O88958 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gnpda1O88958 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gnpda1O88958 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gnpda1O88958 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gnpda1O88958 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gnpda1O88958 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gnpda1O88958 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gnpda1O88958 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gnpda1O88958 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gnpda1O88958 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gnpda1O88958 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gnpda1O88958 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gnpda1O88958 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gnpda1O88958 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gnpda1O88958 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gnpda1O88958 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gnpda1O88958 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gnpda1O88958 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gnpda1O88958 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gnpda1O88958 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gnpda1O88958 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gnpda1O88958 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Gnpda1O88958 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gnpda1O88958 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gnpda1O88958 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gnpda1O88958 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gnpda1O88958 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gnpda1O88958 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gnpda1O88958 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gnpda1O88958 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gnpda1O88958 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gnpda1O88958 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gnpda1O88958 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gnpda1O88958 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gnpda1O88958 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gnpda1O88958 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gnpda1O88958 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gnpda1O88958 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gnpda1O88958 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gnpda1O88958 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gnpda1O88958 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gnpda1O88958 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gnpda1O88958 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gnpda1O88958 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gnpda1O88958 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gnpda1O88958 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gnpda1O88958 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gnpda1O88958 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gnpda1O88958 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gnpda1O88958 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gnpda1O88958 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gnpda1O88958 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gnpda1O88958 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gnpda1O88958 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gnpda1O88958 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gnpda1O88958 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gnpda1O88958 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gnpda1O88958 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gnpda1O88958 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gnpda1O88958 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gnpda1O88958 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gnpda1O88958 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gnpda1O88958 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gnpda1O88958 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gnpda1O88958 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gnpda1O88958 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gnpda1O88958 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gnpda1O88958 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gnpda1O88958 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gnpda1O88958 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gnpda1O88958 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms