Protein–RNA interactions for Protein: O88705

Hcn3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn3O88705 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hcn3O88705 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hcn3O88705 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hcn3O88705 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hcn3O88705 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hcn3O88705 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hcn3O88705 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hcn3O88705 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hcn3O88705 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hcn3O88705 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hcn3O88705 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hcn3O88705 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hcn3O88705 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hcn3O88705 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hcn3O88705 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Hcn3O88705 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hcn3O88705 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hcn3O88705 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hcn3O88705 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hcn3O88705 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hcn3O88705 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hcn3O88705 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hcn3O88705 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hcn3O88705 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hcn3O88705 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hcn3O88705 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hcn3O88705 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hcn3O88705 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hcn3O88705 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hcn3O88705 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hcn3O88705 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hcn3O88705 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hcn3O88705 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hcn3O88705 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Hcn3O88705 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Hcn3O88705 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hcn3O88705 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Hcn3O88705 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hcn3O88705 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hcn3O88705 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hcn3O88705 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hcn3O88705 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hcn3O88705 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hcn3O88705 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hcn3O88705 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hcn3O88705 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hcn3O88705 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hcn3O88705 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hcn3O88705 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hcn3O88705 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hcn3O88705 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hcn3O88705 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hcn3O88705 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hcn3O88705 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hcn3O88705 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hcn3O88705 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hcn3O88705 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hcn3O88705 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hcn3O88705 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Hcn3O88705 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hcn3O88705 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hcn3O88705 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hcn3O88705 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Hcn3O88705 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hcn3O88705 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hcn3O88705 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hcn3O88705 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hcn3O88705 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hcn3O88705 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hcn3O88705 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hcn3O88705 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hcn3O88705 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hcn3O88705 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hcn3O88705 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hcn3O88705 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hcn3O88705 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hcn3O88705 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hcn3O88705 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hcn3O88705 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hcn3O88705 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hcn3O88705 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Hcn3O88705 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hcn3O88705 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hcn3O88705 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hcn3O88705 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hcn3O88705 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hcn3O88705 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hcn3O88705 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hcn3O88705 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hcn3O88705 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hcn3O88705 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hcn3O88705 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hcn3O88705 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hcn3O88705 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hcn3O88705 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hcn3O88705 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hcn3O88705 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hcn3O88705 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hcn3O88705 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Hcn3O88705 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms