Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dnmt3bO88509 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Dnmt3bO88509 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dnmt3bO88509 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dnmt3bO88509 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dnmt3bO88509 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dnmt3bO88509 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dnmt3bO88509 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dnmt3bO88509 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dnmt3bO88509 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dnmt3bO88509 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dnmt3bO88509 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dnmt3bO88509 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dnmt3bO88509 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dnmt3bO88509 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dnmt3bO88509 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dnmt3bO88509 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dnmt3bO88509 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dnmt3bO88509 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dnmt3bO88509 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dnmt3bO88509 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dnmt3bO88509 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dnmt3bO88509 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dnmt3bO88509 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dnmt3bO88509 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dnmt3bO88509 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dnmt3bO88509 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dnmt3bO88509 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dnmt3bO88509 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dnmt3bO88509 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dnmt3bO88509 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Dnmt3bO88509 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Dnmt3bO88509 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Dnmt3bO88509 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dnmt3bO88509 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dnmt3bO88509 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dnmt3bO88509 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dnmt3bO88509 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dnmt3bO88509 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dnmt3bO88509 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dnmt3bO88509 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dnmt3bO88509 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dnmt3bO88509 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dnmt3bO88509 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dnmt3bO88509 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dnmt3bO88509 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dnmt3bO88509 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dnmt3bO88509 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dnmt3bO88509 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dnmt3bO88509 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dnmt3bO88509 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dnmt3bO88509 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dnmt3bO88509 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dnmt3bO88509 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dnmt3bO88509 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dnmt3bO88509 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dnmt3bO88509 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dnmt3bO88509 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dnmt3bO88509 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Dnmt3bO88509 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dnmt3bO88509 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dnmt3bO88509 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Dnmt3bO88509 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dnmt3bO88509 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dnmt3bO88509 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Dnmt3bO88509 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dnmt3bO88509 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dnmt3bO88509 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dnmt3bO88509 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dnmt3bO88509 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dnmt3bO88509 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dnmt3bO88509 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dnmt3bO88509 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dnmt3bO88509 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dnmt3bO88509 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dnmt3bO88509 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dnmt3bO88509 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Dnmt3bO88509 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dnmt3bO88509 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dnmt3bO88509 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dnmt3bO88509 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dnmt3bO88509 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dnmt3bO88509 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dnmt3bO88509 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dnmt3bO88509 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dnmt3bO88509 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dnmt3bO88509 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dnmt3bO88509 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dnmt3bO88509 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dnmt3bO88509 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dnmt3bO88509 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dnmt3bO88509 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dnmt3bO88509 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dnmt3bO88509 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dnmt3bO88509 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dnmt3bO88509 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dnmt3bO88509 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dnmt3bO88509 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dnmt3bO88509 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dnmt3bO88509 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms