Protein–RNA interactions for Protein: O88485

Dync1i1, Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dync1i1O88485 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dync1i1O88485 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dync1i1O88485 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dync1i1O88485 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dync1i1O88485 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dync1i1O88485 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dync1i1O88485 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dync1i1O88485 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dync1i1O88485 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dync1i1O88485 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dync1i1O88485 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dync1i1O88485 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dync1i1O88485 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dync1i1O88485 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dync1i1O88485 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dync1i1O88485 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dync1i1O88485 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dync1i1O88485 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dync1i1O88485 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dync1i1O88485 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Dync1i1O88485 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dync1i1O88485 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dync1i1O88485 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dync1i1O88485 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dync1i1O88485 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dync1i1O88485 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dync1i1O88485 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dync1i1O88485 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dync1i1O88485 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dync1i1O88485 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dync1i1O88485 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dync1i1O88485 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dync1i1O88485 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dync1i1O88485 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dync1i1O88485 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dync1i1O88485 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dync1i1O88485 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dync1i1O88485 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dync1i1O88485 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dync1i1O88485 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dync1i1O88485 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dync1i1O88485 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dync1i1O88485 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dync1i1O88485 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dync1i1O88485 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dync1i1O88485 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dync1i1O88485 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dync1i1O88485 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dync1i1O88485 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dync1i1O88485 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dync1i1O88485 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dync1i1O88485 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dync1i1O88485 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dync1i1O88485 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dync1i1O88485 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dync1i1O88485 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dync1i1O88485 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dync1i1O88485 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dync1i1O88485 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dync1i1O88485 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dync1i1O88485 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dync1i1O88485 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dync1i1O88485 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dync1i1O88485 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dync1i1O88485 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dync1i1O88485 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dync1i1O88485 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Dync1i1O88485 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dync1i1O88485 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dync1i1O88485 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dync1i1O88485 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dync1i1O88485 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dync1i1O88485 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dync1i1O88485 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dync1i1O88485 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dync1i1O88485 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dync1i1O88485 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dync1i1O88485 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dync1i1O88485 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dync1i1O88485 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dync1i1O88485 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dync1i1O88485 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dync1i1O88485 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dync1i1O88485 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dync1i1O88485 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dync1i1O88485 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dync1i1O88485 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dync1i1O88485 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dync1i1O88485 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dync1i1O88485 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dync1i1O88485 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dync1i1O88485 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dync1i1O88485 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dync1i1O88485 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dync1i1O88485 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dync1i1O88485 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dync1i1O88485 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dync1i1O88485 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dync1i1O88485 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dync1i1O88485 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms