Protein–RNA interactions for Protein: O70572

Smpd2, Sphingomyelin phosphodiesterase 2, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd2O70572 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smpd2O70572 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smpd2O70572 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smpd2O70572 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smpd2O70572 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Smpd2O70572 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smpd2O70572 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smpd2O70572 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smpd2O70572 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smpd2O70572 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Smpd2O70572 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smpd2O70572 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Smpd2O70572 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smpd2O70572 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smpd2O70572 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smpd2O70572 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smpd2O70572 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smpd2O70572 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smpd2O70572 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smpd2O70572 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smpd2O70572 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smpd2O70572 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smpd2O70572 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smpd2O70572 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smpd2O70572 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Smpd2O70572 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smpd2O70572 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Smpd2O70572 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Smpd2O70572 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smpd2O70572 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smpd2O70572 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Smpd2O70572 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smpd2O70572 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smpd2O70572 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smpd2O70572 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smpd2O70572 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smpd2O70572 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smpd2O70572 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smpd2O70572 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smpd2O70572 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smpd2O70572 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smpd2O70572 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smpd2O70572 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smpd2O70572 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Smpd2O70572 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smpd2O70572 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smpd2O70572 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smpd2O70572 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smpd2O70572 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smpd2O70572 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smpd2O70572 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smpd2O70572 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smpd2O70572 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Smpd2O70572 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smpd2O70572 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Smpd2O70572 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Smpd2O70572 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smpd2O70572 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smpd2O70572 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smpd2O70572 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smpd2O70572 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smpd2O70572 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Smpd2O70572 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smpd2O70572 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smpd2O70572 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smpd2O70572 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smpd2O70572 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smpd2O70572 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smpd2O70572 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smpd2O70572 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smpd2O70572 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smpd2O70572 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smpd2O70572 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smpd2O70572 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smpd2O70572 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smpd2O70572 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smpd2O70572 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smpd2O70572 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smpd2O70572 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smpd2O70572 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smpd2O70572 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smpd2O70572 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Smpd2O70572 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smpd2O70572 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smpd2O70572 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smpd2O70572 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smpd2O70572 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smpd2O70572 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smpd2O70572 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smpd2O70572 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smpd2O70572 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smpd2O70572 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smpd2O70572 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smpd2O70572 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smpd2O70572 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smpd2O70572 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smpd2O70572 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smpd2O70572 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smpd2O70572 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smpd2O70572 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms