Protein–RNA interactions for Protein: O70435

Psma3, Proteasome subunit alpha type-3, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma3O70435 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psma3O70435 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Psma3O70435 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psma3O70435 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psma3O70435 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psma3O70435 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psma3O70435 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psma3O70435 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Psma3O70435 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psma3O70435 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psma3O70435 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psma3O70435 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psma3O70435 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psma3O70435 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Psma3O70435 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psma3O70435 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psma3O70435 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psma3O70435 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psma3O70435 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psma3O70435 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Psma3O70435 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psma3O70435 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psma3O70435 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psma3O70435 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psma3O70435 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psma3O70435 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psma3O70435 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psma3O70435 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psma3O70435 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psma3O70435 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psma3O70435 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psma3O70435 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psma3O70435 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psma3O70435 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Psma3O70435 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psma3O70435 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psma3O70435 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psma3O70435 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psma3O70435 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psma3O70435 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psma3O70435 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psma3O70435 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psma3O70435 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psma3O70435 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psma3O70435 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psma3O70435 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psma3O70435 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psma3O70435 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psma3O70435 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psma3O70435 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psma3O70435 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psma3O70435 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Psma3O70435 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psma3O70435 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psma3O70435 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psma3O70435 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psma3O70435 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psma3O70435 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psma3O70435 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psma3O70435 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psma3O70435 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psma3O70435 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psma3O70435 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psma3O70435 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psma3O70435 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psma3O70435 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psma3O70435 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psma3O70435 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psma3O70435 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Psma3O70435 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psma3O70435 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Psma3O70435 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psma3O70435 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psma3O70435 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psma3O70435 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psma3O70435 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psma3O70435 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psma3O70435 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psma3O70435 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psma3O70435 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psma3O70435 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psma3O70435 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psma3O70435 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Psma3O70435 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psma3O70435 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psma3O70435 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psma3O70435 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psma3O70435 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psma3O70435 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psma3O70435 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psma3O70435 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psma3O70435 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psma3O70435 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psma3O70435 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psma3O70435 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psma3O70435 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psma3O70435 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psma3O70435 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psma3O70435 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psma3O70435 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms