Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Xirp1O70373 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Xirp1O70373 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Xirp1O70373 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Xirp1O70373 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Xirp1O70373 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Xirp1O70373 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Xirp1O70373 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Xirp1O70373 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Xirp1O70373 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Xirp1O70373 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Xirp1O70373 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Xirp1O70373 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Xirp1O70373 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Xirp1O70373 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Xirp1O70373 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Xirp1O70373 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Xirp1O70373 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Xirp1O70373 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Xirp1O70373 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Xirp1O70373 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Xirp1O70373 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Xirp1O70373 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Xirp1O70373 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Xirp1O70373 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Xirp1O70373 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Xirp1O70373 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Xirp1O70373 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Xirp1O70373 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Xirp1O70373 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Xirp1O70373 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Xirp1O70373 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Xirp1O70373 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Xirp1O70373 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Xirp1O70373 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Xirp1O70373 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Xirp1O70373 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Xirp1O70373 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Xirp1O70373 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Xirp1O70373 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Xirp1O70373 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Xirp1O70373 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Xirp1O70373 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Xirp1O70373 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Xirp1O70373 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Xirp1O70373 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Xirp1O70373 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Xirp1O70373 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Xirp1O70373 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Xirp1O70373 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Xirp1O70373 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Xirp1O70373 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Xirp1O70373 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Xirp1O70373 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Xirp1O70373 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Xirp1O70373 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Xirp1O70373 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Xirp1O70373 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Xirp1O70373 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Xirp1O70373 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Xirp1O70373 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Xirp1O70373 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Xirp1O70373 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Xirp1O70373 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Xirp1O70373 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Xirp1O70373 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Xirp1O70373 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Xirp1O70373 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Xirp1O70373 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Xirp1O70373 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Xirp1O70373 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Xirp1O70373 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Xirp1O70373 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Xirp1O70373 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Xirp1O70373 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Xirp1O70373 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Xirp1O70373 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Xirp1O70373 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Xirp1O70373 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Xirp1O70373 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Xirp1O70373 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Xirp1O70373 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Xirp1O70373 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Xirp1O70373 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Xirp1O70373 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Xirp1O70373 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Xirp1O70373 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Xirp1O70373 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Xirp1O70373 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Xirp1O70373 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Xirp1O70373 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Xirp1O70373 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Xirp1O70373 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Xirp1O70373 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Xirp1O70373 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Xirp1O70373 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Xirp1O70373 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Xirp1O70373 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Xirp1O70373 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Xirp1O70373 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms