Protein–RNA interactions for Protein: O70157

Top3a, DNA topoisomerase 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3aO70157 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Top3aO70157 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Top3aO70157 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Top3aO70157 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Top3aO70157 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Top3aO70157 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Top3aO70157 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Top3aO70157 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Top3aO70157 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Top3aO70157 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Top3aO70157 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Top3aO70157 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Top3aO70157 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Top3aO70157 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Top3aO70157 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Top3aO70157 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Top3aO70157 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Top3aO70157 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Top3aO70157 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Top3aO70157 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Top3aO70157 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Top3aO70157 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Top3aO70157 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Top3aO70157 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Top3aO70157 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Top3aO70157 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Top3aO70157 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Top3aO70157 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Top3aO70157 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Top3aO70157 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Top3aO70157 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Top3aO70157 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Top3aO70157 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Top3aO70157 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Top3aO70157 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top3aO70157 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top3aO70157 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top3aO70157 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top3aO70157 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Top3aO70157 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top3aO70157 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top3aO70157 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top3aO70157 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Top3aO70157 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Top3aO70157 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Top3aO70157 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Top3aO70157 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Top3aO70157 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Top3aO70157 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Top3aO70157 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Top3aO70157 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Top3aO70157 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Top3aO70157 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Top3aO70157 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Top3aO70157 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Top3aO70157 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Top3aO70157 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Top3aO70157 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Top3aO70157 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Top3aO70157 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Top3aO70157 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Top3aO70157 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Top3aO70157 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Top3aO70157 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Top3aO70157 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Top3aO70157 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Top3aO70157 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Top3aO70157 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Top3aO70157 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Top3aO70157 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Top3aO70157 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Top3aO70157 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Top3aO70157 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Top3aO70157 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Top3aO70157 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Top3aO70157 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Top3aO70157 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Top3aO70157 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Top3aO70157 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Top3aO70157 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Top3aO70157 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Top3aO70157 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Top3aO70157 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Top3aO70157 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Top3aO70157 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Top3aO70157 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Top3aO70157 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Top3aO70157 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Top3aO70157 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Top3aO70157 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Top3aO70157 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Top3aO70157 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Top3aO70157 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Top3aO70157 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Top3aO70157 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Top3aO70157 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Top3aO70157 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Top3aO70157 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Top3aO70157 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Top3aO70157 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.2 ms