Protein–RNA interactions for Protein: O55226

Chad, Chondroadherin, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChadO55226 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ChadO55226 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ChadO55226 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ChadO55226 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ChadO55226 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ChadO55226 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ChadO55226 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ChadO55226 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ChadO55226 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ChadO55226 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ChadO55226 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ChadO55226 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ChadO55226 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ChadO55226 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ChadO55226 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ChadO55226 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ChadO55226 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ChadO55226 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ChadO55226 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ChadO55226 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ChadO55226 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ChadO55226 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ChadO55226 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ChadO55226 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ChadO55226 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ChadO55226 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ChadO55226 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ChadO55226 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ChadO55226 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ChadO55226 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ChadO55226 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ChadO55226 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ChadO55226 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ChadO55226 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ChadO55226 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ChadO55226 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ChadO55226 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ChadO55226 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ChadO55226 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ChadO55226 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ChadO55226 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ChadO55226 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ChadO55226 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ChadO55226 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ChadO55226 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ChadO55226 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ChadO55226 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ChadO55226 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ChadO55226 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ChadO55226 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ChadO55226 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ChadO55226 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ChadO55226 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ChadO55226 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ChadO55226 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ChadO55226 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ChadO55226 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ChadO55226 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ChadO55226 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ChadO55226 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ChadO55226 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ChadO55226 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ChadO55226 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ChadO55226 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ChadO55226 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ChadO55226 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ChadO55226 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ChadO55226 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ChadO55226 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ChadO55226 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ChadO55226 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ChadO55226 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ChadO55226 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ChadO55226 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ChadO55226 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ChadO55226 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ChadO55226 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ChadO55226 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ChadO55226 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ChadO55226 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ChadO55226 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ChadO55226 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ChadO55226 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ChadO55226 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ChadO55226 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ChadO55226 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ChadO55226 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ChadO55226 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ChadO55226 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ChadO55226 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ChadO55226 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ChadO55226 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ChadO55226 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ChadO55226 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ChadO55226 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ChadO55226 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ChadO55226 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ChadO55226 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ChadO55226 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ChadO55226 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms