Protein–RNA interactions for Protein: O55222

Ilk, Integrin-linked protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IlkO55222 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IlkO55222 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IlkO55222 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
IlkO55222 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IlkO55222 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IlkO55222 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IlkO55222 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IlkO55222 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IlkO55222 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IlkO55222 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IlkO55222 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IlkO55222 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
IlkO55222 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IlkO55222 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IlkO55222 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IlkO55222 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IlkO55222 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IlkO55222 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IlkO55222 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IlkO55222 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IlkO55222 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IlkO55222 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IlkO55222 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IlkO55222 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IlkO55222 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IlkO55222 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IlkO55222 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IlkO55222 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IlkO55222 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IlkO55222 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IlkO55222 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IlkO55222 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IlkO55222 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IlkO55222 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IlkO55222 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IlkO55222 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IlkO55222 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IlkO55222 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IlkO55222 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IlkO55222 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IlkO55222 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IlkO55222 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IlkO55222 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IlkO55222 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IlkO55222 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IlkO55222 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IlkO55222 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IlkO55222 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IlkO55222 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IlkO55222 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IlkO55222 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IlkO55222 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IlkO55222 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IlkO55222 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IlkO55222 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IlkO55222 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IlkO55222 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IlkO55222 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
IlkO55222 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IlkO55222 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IlkO55222 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IlkO55222 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IlkO55222 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IlkO55222 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IlkO55222 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IlkO55222 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IlkO55222 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
IlkO55222 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IlkO55222 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IlkO55222 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IlkO55222 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IlkO55222 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IlkO55222 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IlkO55222 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
IlkO55222 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
IlkO55222 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
IlkO55222 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IlkO55222 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IlkO55222 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IlkO55222 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IlkO55222 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IlkO55222 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IlkO55222 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IlkO55222 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IlkO55222 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IlkO55222 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IlkO55222 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IlkO55222 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IlkO55222 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IlkO55222 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IlkO55222 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IlkO55222 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IlkO55222 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
IlkO55222 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22■■□□□ 1.11
IlkO55222 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22■■□□□ 1.11
IlkO55222 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IlkO55222 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IlkO55222 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IlkO55222 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
IlkO55222 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms