Protein–RNA interactions for Protein: O55142

Rpl35a, 60S ribosomal protein L35a, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35aO55142 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl35aO55142 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl35aO55142 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl35aO55142 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl35aO55142 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl35aO55142 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl35aO55142 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl35aO55142 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl35aO55142 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl35aO55142 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl35aO55142 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl35aO55142 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl35aO55142 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl35aO55142 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl35aO55142 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl35aO55142 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl35aO55142 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl35aO55142 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl35aO55142 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl35aO55142 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl35aO55142 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl35aO55142 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl35aO55142 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl35aO55142 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl35aO55142 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl35aO55142 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl35aO55142 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl35aO55142 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl35aO55142 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl35aO55142 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl35aO55142 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl35aO55142 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl35aO55142 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl35aO55142 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl35aO55142 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl35aO55142 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl35aO55142 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl35aO55142 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl35aO55142 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl35aO55142 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl35aO55142 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl35aO55142 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl35aO55142 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl35aO55142 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl35aO55142 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl35aO55142 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl35aO55142 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl35aO55142 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl35aO55142 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl35aO55142 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl35aO55142 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl35aO55142 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl35aO55142 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl35aO55142 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl35aO55142 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl35aO55142 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl35aO55142 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl35aO55142 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl35aO55142 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl35aO55142 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl35aO55142 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl35aO55142 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl35aO55142 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl35aO55142 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl35aO55142 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl35aO55142 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl35aO55142 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl35aO55142 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl35aO55142 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl35aO55142 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl35aO55142 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl35aO55142 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl35aO55142 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl35aO55142 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl35aO55142 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl35aO55142 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl35aO55142 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl35aO55142 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl35aO55142 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl35aO55142 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl35aO55142 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl35aO55142 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl35aO55142 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl35aO55142 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl35aO55142 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl35aO55142 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl35aO55142 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl35aO55142 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl35aO55142 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl35aO55142 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl35aO55142 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl35aO55142 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl35aO55142 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl35aO55142 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl35aO55142 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl35aO55142 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl35aO55142 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl35aO55142 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl35aO55142 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl35aO55142 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms