Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NlkO54949 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NlkO54949 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NlkO54949 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NlkO54949 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NlkO54949 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NlkO54949 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NlkO54949 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NlkO54949 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NlkO54949 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NlkO54949 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NlkO54949 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NlkO54949 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NlkO54949 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NlkO54949 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NlkO54949 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NlkO54949 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NlkO54949 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NlkO54949 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NlkO54949 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NlkO54949 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NlkO54949 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NlkO54949 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NlkO54949 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NlkO54949 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NlkO54949 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NlkO54949 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NlkO54949 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NlkO54949 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NlkO54949 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NlkO54949 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NlkO54949 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NlkO54949 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NlkO54949 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NlkO54949 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NlkO54949 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NlkO54949 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NlkO54949 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NlkO54949 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NlkO54949 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NlkO54949 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NlkO54949 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NlkO54949 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NlkO54949 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NlkO54949 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NlkO54949 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NlkO54949 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NlkO54949 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NlkO54949 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NlkO54949 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NlkO54949 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NlkO54949 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NlkO54949 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NlkO54949 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NlkO54949 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NlkO54949 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NlkO54949 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NlkO54949 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NlkO54949 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NlkO54949 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NlkO54949 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NlkO54949 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NlkO54949 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NlkO54949 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NlkO54949 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NlkO54949 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NlkO54949 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NlkO54949 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NlkO54949 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NlkO54949 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NlkO54949 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NlkO54949 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NlkO54949 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NlkO54949 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NlkO54949 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NlkO54949 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NlkO54949 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NlkO54949 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NlkO54949 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NlkO54949 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NlkO54949 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NlkO54949 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NlkO54949 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NlkO54949 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NlkO54949 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NlkO54949 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NlkO54949 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NlkO54949 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NlkO54949 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NlkO54949 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NlkO54949 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NlkO54949 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NlkO54949 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NlkO54949 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NlkO54949 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NlkO54949 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NlkO54949 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NlkO54949 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NlkO54949 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NlkO54949 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms