Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Smarce1O54941 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smarce1O54941 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smarce1O54941 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smarce1O54941 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smarce1O54941 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smarce1O54941 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smarce1O54941 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smarce1O54941 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smarce1O54941 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smarce1O54941 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smarce1O54941 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smarce1O54941 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smarce1O54941 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smarce1O54941 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smarce1O54941 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smarce1O54941 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Smarce1O54941 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Smarce1O54941 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Smarce1O54941 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Smarce1O54941 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Smarce1O54941 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Smarce1O54941 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Smarce1O54941 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Smarce1O54941 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Smarce1O54941 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Smarce1O54941 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Smarce1O54941 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Smarce1O54941 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Smarce1O54941 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Smarce1O54941 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Smarce1O54941 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Smarce1O54941 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Smarce1O54941 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Smarce1O54941 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Smarce1O54941 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Smarce1O54941 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Smarce1O54941 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Smarce1O54941 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Smarce1O54941 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Smarce1O54941 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Smarce1O54941 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Smarce1O54941 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Smarce1O54941 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Smarce1O54941 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Smarce1O54941 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Smarce1O54941 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Smarce1O54941 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Smarce1O54941 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Smarce1O54941 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Smarce1O54941 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Smarce1O54941 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Smarce1O54941 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Smarce1O54941 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Smarce1O54941 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Smarce1O54941 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Smarce1O54941 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Smarce1O54941 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Smarce1O54941 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Smarce1O54941 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Smarce1O54941 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Smarce1O54941 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Smarce1O54941 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Smarce1O54941 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Smarce1O54941 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Smarce1O54941 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Smarce1O54941 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Smarce1O54941 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Smarce1O54941 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Smarce1O54941 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Smarce1O54941 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smarce1O54941 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Smarce1O54941 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Smarce1O54941 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Smarce1O54941 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Smarce1O54941 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Smarce1O54941 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Smarce1O54941 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Smarce1O54941 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Smarce1O54941 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Smarce1O54941 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarce1O54941 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarce1O54941 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarce1O54941 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarce1O54941 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarce1O54941 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smarce1O54941 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smarce1O54941 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smarce1O54941 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Smarce1O54941 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Smarce1O54941 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Smarce1O54941 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Smarce1O54941 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Smarce1O54941 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Smarce1O54941 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Smarce1O54941 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Smarce1O54941 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Smarce1O54941 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Smarce1O54941 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Smarce1O54941 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms