Protein–RNA interactions for Protein: O35903

Ccl25, C-C motif chemokine 25, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl25O35903 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl25O35903 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl25O35903 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl25O35903 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl25O35903 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl25O35903 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl25O35903 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl25O35903 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl25O35903 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl25O35903 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl25O35903 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl25O35903 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl25O35903 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl25O35903 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl25O35903 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl25O35903 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl25O35903 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl25O35903 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl25O35903 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl25O35903 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl25O35903 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl25O35903 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl25O35903 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl25O35903 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl25O35903 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl25O35903 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl25O35903 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl25O35903 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl25O35903 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl25O35903 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl25O35903 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl25O35903 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl25O35903 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl25O35903 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl25O35903 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl25O35903 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl25O35903 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl25O35903 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl25O35903 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl25O35903 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl25O35903 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccl25O35903 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl25O35903 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl25O35903 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl25O35903 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl25O35903 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl25O35903 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl25O35903 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl25O35903 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl25O35903 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl25O35903 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccl25O35903 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccl25O35903 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccl25O35903 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccl25O35903 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl25O35903 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl25O35903 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl25O35903 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl25O35903 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl25O35903 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl25O35903 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl25O35903 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl25O35903 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl25O35903 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl25O35903 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl25O35903 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl25O35903 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl25O35903 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl25O35903 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl25O35903 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl25O35903 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl25O35903 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl25O35903 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl25O35903 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl25O35903 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccl25O35903 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccl25O35903 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccl25O35903 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccl25O35903 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccl25O35903 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl25O35903 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl25O35903 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl25O35903 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl25O35903 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl25O35903 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl25O35903 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl25O35903 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl25O35903 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl25O35903 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl25O35903 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl25O35903 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl25O35903 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl25O35903 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl25O35903 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl25O35903 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl25O35903 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl25O35903 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl25O35903 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl25O35903 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl25O35903 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms