Protein–RNA interactions for Protein: O35744

Chil3, Chitinase-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chil3O35744 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chil3O35744 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chil3O35744 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chil3O35744 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chil3O35744 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chil3O35744 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chil3O35744 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chil3O35744 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Chil3O35744 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chil3O35744 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Chil3O35744 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chil3O35744 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chil3O35744 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chil3O35744 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chil3O35744 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chil3O35744 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chil3O35744 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chil3O35744 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chil3O35744 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chil3O35744 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chil3O35744 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chil3O35744 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chil3O35744 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chil3O35744 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chil3O35744 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chil3O35744 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chil3O35744 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chil3O35744 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chil3O35744 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chil3O35744 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chil3O35744 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chil3O35744 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chil3O35744 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chil3O35744 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chil3O35744 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chil3O35744 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chil3O35744 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chil3O35744 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chil3O35744 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chil3O35744 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chil3O35744 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chil3O35744 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Chil3O35744 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chil3O35744 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chil3O35744 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chil3O35744 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chil3O35744 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chil3O35744 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chil3O35744 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chil3O35744 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chil3O35744 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chil3O35744 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chil3O35744 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chil3O35744 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chil3O35744 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chil3O35744 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chil3O35744 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Chil3O35744 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chil3O35744 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chil3O35744 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chil3O35744 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chil3O35744 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chil3O35744 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chil3O35744 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Chil3O35744 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chil3O35744 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chil3O35744 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chil3O35744 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Chil3O35744 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chil3O35744 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chil3O35744 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chil3O35744 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chil3O35744 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chil3O35744 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chil3O35744 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chil3O35744 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chil3O35744 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chil3O35744 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chil3O35744 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chil3O35744 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chil3O35744 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chil3O35744 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chil3O35744 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chil3O35744 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chil3O35744 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chil3O35744 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chil3O35744 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Chil3O35744 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chil3O35744 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chil3O35744 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Chil3O35744 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chil3O35744 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chil3O35744 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chil3O35744 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chil3O35744 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chil3O35744 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chil3O35744 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chil3O35744 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chil3O35744 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chil3O35744 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112 ms