Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,12■□□□□ 0,49
Cited2O35740 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,12■□□□□ 0,49
Cited2O35740 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,11■□□□□ 0,49
Cited2O35740 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18,11■□□□□ 0,49
Cited2O35740 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18,11■□□□□ 0,49
Cited2O35740 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18,11■□□□□ 0,49
Cited2O35740 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,1■□□□□ 0,49
Cited2O35740 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,1■□□□□ 0,49
Cited2O35740 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18,1■□□□□ 0,49
Cited2O35740 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,1■□□□□ 0,49
Cited2O35740 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,1■□□□□ 0,49
Cited2O35740 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,1■□□□□ 0,49
Cited2O35740 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18,1■□□□□ 0,49
Cited2O35740 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,1■□□□□ 0,49
Cited2O35740 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,09■□□□□ 0,49
Cited2O35740 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18,09■□□□□ 0,49
Cited2O35740 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,09■□□□□ 0,49
Cited2O35740 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18,09■□□□□ 0,49
Cited2O35740 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,09■□□□□ 0,49
Cited2O35740 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18,09■□□□□ 0,49
Cited2O35740 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18,09■□□□□ 0,49
Cited2O35740 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,08■□□□□ 0,49
Cited2O35740 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,08■□□□□ 0,49
Cited2O35740 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18,08■□□□□ 0,48
Cited2O35740 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18,08■□□□□ 0,48
Cited2O35740 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18,08■□□□□ 0,48
Cited2O35740 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18,08■□□□□ 0,48
Cited2O35740 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,07■□□□□ 0,48
Cited2O35740 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18,07■□□□□ 0,48
Cited2O35740 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,07■□□□□ 0,48
Cited2O35740 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,07■□□□□ 0,48
Cited2O35740 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18,06■□□□□ 0,48
Cited2O35740 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,06■□□□□ 0,48
Cited2O35740 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18,06■□□□□ 0,48
Cited2O35740 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,06■□□□□ 0,48
Cited2O35740 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18,06■□□□□ 0,48
Cited2O35740 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18,06■□□□□ 0,48
Cited2O35740 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,06■□□□□ 0,48
Cited2O35740 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,06■□□□□ 0,48
Cited2O35740 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,06■□□□□ 0,48
Cited2O35740 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,06■□□□□ 0,48
Cited2O35740 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,06■□□□□ 0,48
Cited2O35740 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18,06■□□□□ 0,48
Cited2O35740 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,05■□□□□ 0,48
Cited2O35740 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18,05■□□□□ 0,48
Cited2O35740 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,05■□□□□ 0,48
Cited2O35740 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,05■□□□□ 0,48
Cited2O35740 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,05■□□□□ 0,48
Cited2O35740 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18,05■□□□□ 0,48
Cited2O35740 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,05■□□□□ 0,48
Cited2O35740 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18,04■□□□□ 0,48
Cited2O35740 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,04■□□□□ 0,48
Cited2O35740 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18,04■□□□□ 0,48
Cited2O35740 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,04■□□□□ 0,48
Cited2O35740 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18,04■□□□□ 0,48
Cited2O35740 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18,04■□□□□ 0,48
Cited2O35740 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,03■□□□□ 0,48
Cited2O35740 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,03■□□□□ 0,48
Cited2O35740 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,03■□□□□ 0,48
Cited2O35740 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18,03■□□□□ 0,48
Cited2O35740 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18,03■□□□□ 0,48
Cited2O35740 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18,03■□□□□ 0,48
Cited2O35740 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18,03■□□□□ 0,48
Cited2O35740 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18,03■□□□□ 0,48
Cited2O35740 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,03■□□□□ 0,48
Cited2O35740 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,02■□□□□ 0,48
Cited2O35740 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18,02■□□□□ 0,48
Cited2O35740 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18,02■□□□□ 0,48
Cited2O35740 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18,02■□□□□ 0,48
Cited2O35740 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,02■□□□□ 0,48
Cited2O35740 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,01■□□□□ 0,47
Cited2O35740 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,01■□□□□ 0,47
Cited2O35740 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,01■□□□□ 0,47
Cited2O35740 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0,47
Cited2O35740 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0,47
Cited2O35740 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0,47
Cited2O35740 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18■□□□□ 0,47
Cited2O35740 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0,47
Cited2O35740 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0,47
Cited2O35740 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0,47
Cited2O35740 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0,47
Cited2O35740 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC17,99■□□□□ 0,47
Cited2O35740 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17,99■□□□□ 0,47
Cited2O35740 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,99■□□□□ 0,47
Cited2O35740 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,99■□□□□ 0,47
Cited2O35740 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17,99■□□□□ 0,47
Cited2O35740 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17,99■□□□□ 0,47
Cited2O35740 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17,99■□□□□ 0,47
Cited2O35740 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,99■□□□□ 0,47
Cited2O35740 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,99■□□□□ 0,47
Cited2O35740 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,99■□□□□ 0,47
Cited2O35740 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,98■□□□□ 0,47
Cited2O35740 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17,98■□□□□ 0,47
Cited2O35740 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,98■□□□□ 0,47
Cited2O35740 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17,98■□□□□ 0,47
Cited2O35740 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,98■□□□□ 0,47
Cited2O35740 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17,98■□□□□ 0,47
Cited2O35740 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,98■□□□□ 0,47
Cited2O35740 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,97■□□□□ 0,47
Cited2O35740 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,97■□□□□ 0,47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28,8 ms