Protein–RNA interactions for Protein: O35604

Npc1, Niemann-Pick C1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npc1O35604 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Npc1O35604 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Npc1O35604 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Npc1O35604 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Npc1O35604 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Npc1O35604 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Npc1O35604 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Npc1O35604 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Npc1O35604 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Npc1O35604 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Npc1O35604 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Npc1O35604 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Npc1O35604 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Npc1O35604 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Npc1O35604 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Npc1O35604 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Npc1O35604 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Npc1O35604 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Npc1O35604 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Npc1O35604 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Npc1O35604 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Npc1O35604 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Npc1O35604 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Npc1O35604 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Npc1O35604 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Npc1O35604 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npc1O35604 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npc1O35604 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Npc1O35604 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Npc1O35604 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Npc1O35604 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Npc1O35604 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Npc1O35604 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Npc1O35604 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Npc1O35604 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Npc1O35604 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Npc1O35604 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Npc1O35604 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Npc1O35604 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Npc1O35604 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Npc1O35604 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Npc1O35604 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Npc1O35604 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Npc1O35604 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Npc1O35604 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Npc1O35604 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Npc1O35604 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Npc1O35604 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Npc1O35604 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Npc1O35604 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Npc1O35604 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Npc1O35604 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Npc1O35604 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Npc1O35604 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Npc1O35604 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Npc1O35604 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Npc1O35604 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Npc1O35604 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Npc1O35604 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Npc1O35604 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Npc1O35604 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Npc1O35604 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Npc1O35604 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Npc1O35604 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Npc1O35604 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Npc1O35604 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Npc1O35604 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Npc1O35604 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Npc1O35604 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Npc1O35604 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Npc1O35604 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Npc1O35604 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Npc1O35604 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Npc1O35604 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Npc1O35604 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Npc1O35604 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Npc1O35604 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Npc1O35604 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Npc1O35604 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Npc1O35604 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Npc1O35604 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Npc1O35604 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Npc1O35604 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Npc1O35604 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Npc1O35604 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Npc1O35604 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Npc1O35604 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Npc1O35604 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Npc1O35604 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Npc1O35604 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Npc1O35604 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Npc1O35604 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Npc1O35604 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Npc1O35604 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Npc1O35604 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Npc1O35604 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Npc1O35604 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Npc1O35604 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Npc1O35604 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Npc1O35604 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms