Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Opn1mwO35599 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Opn1mwO35599 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Opn1mwO35599 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Opn1mwO35599 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Opn1mwO35599 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Opn1mwO35599 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Opn1mwO35599 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Opn1mwO35599 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Opn1mwO35599 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Opn1mwO35599 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Opn1mwO35599 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Opn1mwO35599 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Opn1mwO35599 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Opn1mwO35599 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Opn1mwO35599 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Opn1mwO35599 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Opn1mwO35599 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Opn1mwO35599 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Opn1mwO35599 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Opn1mwO35599 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Opn1mwO35599 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Opn1mwO35599 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Opn1mwO35599 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Opn1mwO35599 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Opn1mwO35599 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Opn1mwO35599 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Opn1mwO35599 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Opn1mwO35599 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Opn1mwO35599 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Opn1mwO35599 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Opn1mwO35599 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Opn1mwO35599 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Opn1mwO35599 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Opn1mwO35599 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Opn1mwO35599 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Opn1mwO35599 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Opn1mwO35599 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Opn1mwO35599 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Opn1mwO35599 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Opn1mwO35599 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Opn1mwO35599 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Opn1mwO35599 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Opn1mwO35599 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Opn1mwO35599 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Opn1mwO35599 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Opn1mwO35599 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Opn1mwO35599 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Opn1mwO35599 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Opn1mwO35599 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Opn1mwO35599 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Opn1mwO35599 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Opn1mwO35599 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Opn1mwO35599 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Opn1mwO35599 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Opn1mwO35599 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Opn1mwO35599 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Opn1mwO35599 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Opn1mwO35599 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Opn1mwO35599 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Opn1mwO35599 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Opn1mwO35599 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Opn1mwO35599 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Opn1mwO35599 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Opn1mwO35599 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Opn1mwO35599 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Opn1mwO35599 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Opn1mwO35599 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Opn1mwO35599 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Opn1mwO35599 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Opn1mwO35599 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Opn1mwO35599 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Opn1mwO35599 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Opn1mwO35599 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Opn1mwO35599 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Opn1mwO35599 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Opn1mwO35599 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Opn1mwO35599 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Opn1mwO35599 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Opn1mwO35599 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Opn1mwO35599 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Opn1mwO35599 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Opn1mwO35599 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Opn1mwO35599 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Opn1mwO35599 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Opn1mwO35599 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Opn1mwO35599 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Opn1mwO35599 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Opn1mwO35599 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Opn1mwO35599 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Opn1mwO35599 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Opn1mwO35599 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Opn1mwO35599 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Opn1mwO35599 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Opn1mwO35599 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Opn1mwO35599 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Opn1mwO35599 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Opn1mwO35599 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Opn1mwO35599 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Opn1mwO35599 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms