Protein–RNA interactions for Protein: O35493

Clk4, Dual specificity protein kinase CLK4, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk4O35493 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clk4O35493 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clk4O35493 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clk4O35493 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clk4O35493 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clk4O35493 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clk4O35493 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clk4O35493 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clk4O35493 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Clk4O35493 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clk4O35493 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clk4O35493 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clk4O35493 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clk4O35493 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clk4O35493 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clk4O35493 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clk4O35493 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clk4O35493 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clk4O35493 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clk4O35493 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Clk4O35493 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clk4O35493 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clk4O35493 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clk4O35493 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Clk4O35493 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clk4O35493 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Clk4O35493 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clk4O35493 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Clk4O35493 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clk4O35493 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clk4O35493 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clk4O35493 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clk4O35493 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clk4O35493 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clk4O35493 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clk4O35493 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clk4O35493 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clk4O35493 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Clk4O35493 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Clk4O35493 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clk4O35493 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clk4O35493 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clk4O35493 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clk4O35493 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clk4O35493 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clk4O35493 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clk4O35493 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clk4O35493 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clk4O35493 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clk4O35493 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clk4O35493 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clk4O35493 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clk4O35493 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Clk4O35493 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clk4O35493 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clk4O35493 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clk4O35493 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clk4O35493 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clk4O35493 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clk4O35493 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clk4O35493 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clk4O35493 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clk4O35493 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clk4O35493 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clk4O35493 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clk4O35493 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clk4O35493 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clk4O35493 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clk4O35493 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clk4O35493 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clk4O35493 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clk4O35493 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clk4O35493 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clk4O35493 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clk4O35493 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clk4O35493 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clk4O35493 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clk4O35493 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clk4O35493 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clk4O35493 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clk4O35493 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clk4O35493 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clk4O35493 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clk4O35493 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clk4O35493 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clk4O35493 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clk4O35493 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clk4O35493 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clk4O35493 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clk4O35493 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clk4O35493 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clk4O35493 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clk4O35493 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clk4O35493 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clk4O35493 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clk4O35493 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clk4O35493 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clk4O35493 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clk4O35493 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clk4O35493 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.1 ms