Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc27a2O35488 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc27a2O35488 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc27a2O35488 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc27a2O35488 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc27a2O35488 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc27a2O35488 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc27a2O35488 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc27a2O35488 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc27a2O35488 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc27a2O35488 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc27a2O35488 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc27a2O35488 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc27a2O35488 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc27a2O35488 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc27a2O35488 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc27a2O35488 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc27a2O35488 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc27a2O35488 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc27a2O35488 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc27a2O35488 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc27a2O35488 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc27a2O35488 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc27a2O35488 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc27a2O35488 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc27a2O35488 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc27a2O35488 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc27a2O35488 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc27a2O35488 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc27a2O35488 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc27a2O35488 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc27a2O35488 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc27a2O35488 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc27a2O35488 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc27a2O35488 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc27a2O35488 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc27a2O35488 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc27a2O35488 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc27a2O35488 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc27a2O35488 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc27a2O35488 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc27a2O35488 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc27a2O35488 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc27a2O35488 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc27a2O35488 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc27a2O35488 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc27a2O35488 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc27a2O35488 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc27a2O35488 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc27a2O35488 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc27a2O35488 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc27a2O35488 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc27a2O35488 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc27a2O35488 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc27a2O35488 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc27a2O35488 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc27a2O35488 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc27a2O35488 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc27a2O35488 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc27a2O35488 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc27a2O35488 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc27a2O35488 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc27a2O35488 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc27a2O35488 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc27a2O35488 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc27a2O35488 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc27a2O35488 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc27a2O35488 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc27a2O35488 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc27a2O35488 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc27a2O35488 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc27a2O35488 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc27a2O35488 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc27a2O35488 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc27a2O35488 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc27a2O35488 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc27a2O35488 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc27a2O35488 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc27a2O35488 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc27a2O35488 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc27a2O35488 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc27a2O35488 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc27a2O35488 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc27a2O35488 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc27a2O35488 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc27a2O35488 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc27a2O35488 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc27a2O35488 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc27a2O35488 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc27a2O35488 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc27a2O35488 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc27a2O35488 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc27a2O35488 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc27a2O35488 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc27a2O35488 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc27a2O35488 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc27a2O35488 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc27a2O35488 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc27a2O35488 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc27a2O35488 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.1 ms