Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Xbp1O35426 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Xbp1O35426 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Xbp1O35426 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Xbp1O35426 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Xbp1O35426 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Xbp1O35426 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Xbp1O35426 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Xbp1O35426 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Xbp1O35426 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Xbp1O35426 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Xbp1O35426 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Xbp1O35426 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Xbp1O35426 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Xbp1O35426 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Xbp1O35426 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Xbp1O35426 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Xbp1O35426 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Xbp1O35426 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Xbp1O35426 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Xbp1O35426 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Xbp1O35426 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Xbp1O35426 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Xbp1O35426 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Xbp1O35426 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Xbp1O35426 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Xbp1O35426 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Xbp1O35426 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Xbp1O35426 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Xbp1O35426 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Xbp1O35426 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Xbp1O35426 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Xbp1O35426 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Xbp1O35426 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Xbp1O35426 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Xbp1O35426 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Xbp1O35426 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Xbp1O35426 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Xbp1O35426 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Xbp1O35426 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Xbp1O35426 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Xbp1O35426 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Xbp1O35426 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Xbp1O35426 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Xbp1O35426 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Xbp1O35426 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Xbp1O35426 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Xbp1O35426 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Xbp1O35426 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Xbp1O35426 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Xbp1O35426 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Xbp1O35426 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Xbp1O35426 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Xbp1O35426 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Xbp1O35426 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Xbp1O35426 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Xbp1O35426 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Xbp1O35426 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Xbp1O35426 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Xbp1O35426 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Xbp1O35426 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Xbp1O35426 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Xbp1O35426 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Xbp1O35426 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Xbp1O35426 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Xbp1O35426 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Xbp1O35426 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Xbp1O35426 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Xbp1O35426 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Xbp1O35426 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Xbp1O35426 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Xbp1O35426 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Xbp1O35426 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Xbp1O35426 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Xbp1O35426 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Xbp1O35426 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Xbp1O35426 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Xbp1O35426 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Xbp1O35426 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Xbp1O35426 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Xbp1O35426 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Xbp1O35426 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Xbp1O35426 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Xbp1O35426 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Xbp1O35426 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Xbp1O35426 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Xbp1O35426 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Xbp1O35426 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Xbp1O35426 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Xbp1O35426 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Xbp1O35426 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Xbp1O35426 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Xbp1O35426 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Xbp1O35426 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Xbp1O35426 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Xbp1O35426 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Xbp1O35426 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Xbp1O35426 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Xbp1O35426 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Xbp1O35426 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.8 ms