Protein–RNA interactions for Protein: O35343

Kpna4, Importin subunit alpha-3, mousemouse

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna4O35343 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kpna4O35343 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kpna4O35343 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kpna4O35343 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kpna4O35343 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kpna4O35343 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kpna4O35343 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kpna4O35343 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kpna4O35343 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kpna4O35343 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kpna4O35343 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kpna4O35343 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kpna4O35343 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kpna4O35343 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Kpna4O35343 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kpna4O35343 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Kpna4O35343 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kpna4O35343 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kpna4O35343 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Kpna4O35343 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kpna4O35343 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kpna4O35343 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kpna4O35343 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kpna4O35343 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kpna4O35343 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kpna4O35343 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kpna4O35343 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kpna4O35343 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kpna4O35343 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kpna4O35343 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Kpna4O35343 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Kpna4O35343 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Kpna4O35343 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kpna4O35343 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Kpna4O35343 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kpna4O35343 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kpna4O35343 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kpna4O35343 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kpna4O35343 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Kpna4O35343 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kpna4O35343 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kpna4O35343 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kpna4O35343 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kpna4O35343 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kpna4O35343 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kpna4O35343 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kpna4O35343 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kpna4O35343 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kpna4O35343 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Kpna4O35343 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kpna4O35343 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kpna4O35343 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kpna4O35343 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kpna4O35343 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kpna4O35343 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kpna4O35343 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kpna4O35343 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kpna4O35343 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kpna4O35343 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Kpna4O35343 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kpna4O35343 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kpna4O35343 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kpna4O35343 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kpna4O35343 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kpna4O35343 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kpna4O35343 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Kpna4O35343 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kpna4O35343 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kpna4O35343 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kpna4O35343 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kpna4O35343 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kpna4O35343 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kpna4O35343 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kpna4O35343 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kpna4O35343 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kpna4O35343 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kpna4O35343 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kpna4O35343 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kpna4O35343 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kpna4O35343 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Kpna4O35343 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Kpna4O35343 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Kpna4O35343 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kpna4O35343 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kpna4O35343 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kpna4O35343 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kpna4O35343 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kpna4O35343 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Kpna4O35343 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Kpna4O35343 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Kpna4O35343 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kpna4O35343 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kpna4O35343 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kpna4O35343 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kpna4O35343 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kpna4O35343 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kpna4O35343 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kpna4O35343 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kpna4O35343 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kpna4O35343 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms