Protein–RNA interactions for Protein: O35316

Slc6a6, Sodium- and chloride-dependent taurine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a6O35316 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc6a6O35316 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc6a6O35316 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc6a6O35316 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc6a6O35316 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc6a6O35316 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc6a6O35316 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc6a6O35316 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc6a6O35316 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc6a6O35316 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc6a6O35316 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc6a6O35316 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc6a6O35316 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc6a6O35316 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc6a6O35316 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc6a6O35316 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc6a6O35316 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc6a6O35316 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc6a6O35316 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc6a6O35316 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc6a6O35316 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc6a6O35316 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc6a6O35316 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc6a6O35316 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc6a6O35316 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc6a6O35316 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc6a6O35316 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc6a6O35316 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc6a6O35316 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc6a6O35316 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc6a6O35316 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc6a6O35316 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc6a6O35316 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc6a6O35316 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Slc6a6O35316 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc6a6O35316 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc6a6O35316 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc6a6O35316 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc6a6O35316 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc6a6O35316 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc6a6O35316 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc6a6O35316 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc6a6O35316 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc6a6O35316 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc6a6O35316 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc6a6O35316 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc6a6O35316 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc6a6O35316 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc6a6O35316 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc6a6O35316 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slc6a6O35316 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slc6a6O35316 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc6a6O35316 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc6a6O35316 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc6a6O35316 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc6a6O35316 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc6a6O35316 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc6a6O35316 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc6a6O35316 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc6a6O35316 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc6a6O35316 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc6a6O35316 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc6a6O35316 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc6a6O35316 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc6a6O35316 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc6a6O35316 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc6a6O35316 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc6a6O35316 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc6a6O35316 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc6a6O35316 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc6a6O35316 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc6a6O35316 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc6a6O35316 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc6a6O35316 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc6a6O35316 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc6a6O35316 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc6a6O35316 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc6a6O35316 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc6a6O35316 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc6a6O35316 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc6a6O35316 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc6a6O35316 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc6a6O35316 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc6a6O35316 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc6a6O35316 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc6a6O35316 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc6a6O35316 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc6a6O35316 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc6a6O35316 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc6a6O35316 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc6a6O35316 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc6a6O35316 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc6a6O35316 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc6a6O35316 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc6a6O35316 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc6a6O35316 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc6a6O35316 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc6a6O35316 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc6a6O35316 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc6a6O35316 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms