Protein–RNA interactions for Protein: O35305

Tnfrsf11a, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf11aO35305 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnfrsf11aO35305 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnfrsf11aO35305 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnfrsf11aO35305 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnfrsf11aO35305 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnfrsf11aO35305 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnfrsf11aO35305 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnfrsf11aO35305 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnfrsf11aO35305 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnfrsf11aO35305 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnfrsf11aO35305 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnfrsf11aO35305 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnfrsf11aO35305 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnfrsf11aO35305 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnfrsf11aO35305 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnfrsf11aO35305 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnfrsf11aO35305 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnfrsf11aO35305 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnfrsf11aO35305 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnfrsf11aO35305 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tnfrsf11aO35305 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tnfrsf11aO35305 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnfrsf11aO35305 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnfrsf11aO35305 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnfrsf11aO35305 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnfrsf11aO35305 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnfrsf11aO35305 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnfrsf11aO35305 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnfrsf11aO35305 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnfrsf11aO35305 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnfrsf11aO35305 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnfrsf11aO35305 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnfrsf11aO35305 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnfrsf11aO35305 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnfrsf11aO35305 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnfrsf11aO35305 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnfrsf11aO35305 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnfrsf11aO35305 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnfrsf11aO35305 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnfrsf11aO35305 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnfrsf11aO35305 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnfrsf11aO35305 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnfrsf11aO35305 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnfrsf11aO35305 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnfrsf11aO35305 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnfrsf11aO35305 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnfrsf11aO35305 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tnfrsf11aO35305 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tnfrsf11aO35305 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Tnfrsf11aO35305 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnfrsf11aO35305 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnfrsf11aO35305 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnfrsf11aO35305 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnfrsf11aO35305 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnfrsf11aO35305 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnfrsf11aO35305 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnfrsf11aO35305 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnfrsf11aO35305 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnfrsf11aO35305 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnfrsf11aO35305 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnfrsf11aO35305 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnfrsf11aO35305 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnfrsf11aO35305 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnfrsf11aO35305 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnfrsf11aO35305 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnfrsf11aO35305 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnfrsf11aO35305 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnfrsf11aO35305 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnfrsf11aO35305 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnfrsf11aO35305 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnfrsf11aO35305 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnfrsf11aO35305 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnfrsf11aO35305 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnfrsf11aO35305 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnfrsf11aO35305 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnfrsf11aO35305 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnfrsf11aO35305 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnfrsf11aO35305 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnfrsf11aO35305 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnfrsf11aO35305 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnfrsf11aO35305 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnfrsf11aO35305 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnfrsf11aO35305 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnfrsf11aO35305 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnfrsf11aO35305 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnfrsf11aO35305 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnfrsf11aO35305 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnfrsf11aO35305 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnfrsf11aO35305 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnfrsf11aO35305 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnfrsf11aO35305 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnfrsf11aO35305 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnfrsf11aO35305 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnfrsf11aO35305 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnfrsf11aO35305 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnfrsf11aO35305 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnfrsf11aO35305 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnfrsf11aO35305 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tnfrsf11aO35305 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tnfrsf11aO35305 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.1 ms