Protein–RNA interactions for Protein: O35226

Psmd4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd4O35226 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psmd4O35226 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psmd4O35226 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psmd4O35226 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psmd4O35226 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psmd4O35226 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psmd4O35226 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psmd4O35226 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psmd4O35226 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psmd4O35226 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psmd4O35226 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psmd4O35226 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psmd4O35226 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psmd4O35226 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psmd4O35226 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psmd4O35226 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psmd4O35226 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psmd4O35226 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psmd4O35226 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psmd4O35226 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psmd4O35226 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psmd4O35226 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Psmd4O35226 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psmd4O35226 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psmd4O35226 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psmd4O35226 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psmd4O35226 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Psmd4O35226 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psmd4O35226 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psmd4O35226 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psmd4O35226 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psmd4O35226 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Psmd4O35226 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psmd4O35226 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psmd4O35226 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psmd4O35226 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psmd4O35226 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psmd4O35226 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Psmd4O35226 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psmd4O35226 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psmd4O35226 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psmd4O35226 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Psmd4O35226 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psmd4O35226 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psmd4O35226 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psmd4O35226 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psmd4O35226 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Psmd4O35226 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Psmd4O35226 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psmd4O35226 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psmd4O35226 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psmd4O35226 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Psmd4O35226 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psmd4O35226 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Psmd4O35226 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psmd4O35226 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psmd4O35226 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psmd4O35226 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psmd4O35226 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psmd4O35226 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psmd4O35226 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psmd4O35226 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psmd4O35226 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psmd4O35226 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psmd4O35226 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psmd4O35226 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psmd4O35226 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psmd4O35226 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psmd4O35226 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psmd4O35226 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psmd4O35226 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psmd4O35226 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psmd4O35226 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psmd4O35226 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psmd4O35226 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psmd4O35226 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psmd4O35226 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psmd4O35226 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psmd4O35226 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psmd4O35226 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psmd4O35226 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Psmd4O35226 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Psmd4O35226 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Psmd4O35226 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psmd4O35226 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psmd4O35226 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psmd4O35226 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psmd4O35226 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psmd4O35226 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psmd4O35226 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psmd4O35226 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psmd4O35226 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psmd4O35226 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psmd4O35226 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psmd4O35226 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psmd4O35226 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psmd4O35226 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psmd4O35226 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psmd4O35226 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psmd4O35226 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms