Protein–RNA interactions for Protein: O08546

U90926, Putative TNF-resistance related protein, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U90926O08546 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
U90926O08546 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
U90926O08546 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
U90926O08546 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
U90926O08546 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
U90926O08546 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
U90926O08546 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
U90926O08546 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
U90926O08546 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
U90926O08546 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
U90926O08546 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
U90926O08546 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
U90926O08546 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
U90926O08546 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
U90926O08546 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
U90926O08546 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
U90926O08546 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
U90926O08546 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
U90926O08546 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
U90926O08546 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
U90926O08546 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
U90926O08546 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
U90926O08546 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
U90926O08546 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
U90926O08546 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
U90926O08546 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
U90926O08546 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
U90926O08546 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
U90926O08546 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
U90926O08546 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
U90926O08546 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
U90926O08546 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
U90926O08546 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
U90926O08546 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
U90926O08546 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
U90926O08546 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
U90926O08546 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
U90926O08546 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
U90926O08546 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
U90926O08546 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
U90926O08546 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
U90926O08546 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
U90926O08546 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
U90926O08546 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
U90926O08546 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
U90926O08546 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
U90926O08546 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
U90926O08546 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
U90926O08546 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
U90926O08546 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
U90926O08546 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
U90926O08546 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
U90926O08546 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
U90926O08546 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
U90926O08546 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
U90926O08546 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
U90926O08546 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
U90926O08546 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
U90926O08546 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
U90926O08546 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
U90926O08546 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
U90926O08546 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
U90926O08546 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
U90926O08546 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
U90926O08546 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
U90926O08546 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
U90926O08546 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
U90926O08546 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
U90926O08546 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
U90926O08546 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
U90926O08546 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
U90926O08546 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
U90926O08546 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
U90926O08546 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
U90926O08546 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
U90926O08546 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
U90926O08546 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
U90926O08546 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
U90926O08546 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
U90926O08546 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
U90926O08546 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
U90926O08546 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
U90926O08546 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
U90926O08546 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
U90926O08546 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
U90926O08546 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
U90926O08546 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
U90926O08546 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
U90926O08546 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
U90926O08546 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
U90926O08546 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
U90926O08546 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
U90926O08546 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
U90926O08546 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
U90926O08546 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
U90926O08546 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
U90926O08546 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
U90926O08546 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
U90926O08546 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
U90926O08546 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms