Protein–RNA interactions for Protein: O08532

Cacna2d1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d1O08532 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cacna2d1O08532 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cacna2d1O08532 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cacna2d1O08532 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cacna2d1O08532 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cacna2d1O08532 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cacna2d1O08532 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cacna2d1O08532 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cacna2d1O08532 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cacna2d1O08532 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cacna2d1O08532 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cacna2d1O08532 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cacna2d1O08532 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cacna2d1O08532 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cacna2d1O08532 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cacna2d1O08532 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cacna2d1O08532 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cacna2d1O08532 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cacna2d1O08532 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cacna2d1O08532 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cacna2d1O08532 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cacna2d1O08532 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cacna2d1O08532 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cacna2d1O08532 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cacna2d1O08532 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacna2d1O08532 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacna2d1O08532 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacna2d1O08532 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacna2d1O08532 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacna2d1O08532 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacna2d1O08532 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacna2d1O08532 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacna2d1O08532 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cacna2d1O08532 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cacna2d1O08532 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cacna2d1O08532 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cacna2d1O08532 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cacna2d1O08532 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cacna2d1O08532 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cacna2d1O08532 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cacna2d1O08532 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cacna2d1O08532 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cacna2d1O08532 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cacna2d1O08532 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cacna2d1O08532 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cacna2d1O08532 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacna2d1O08532 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacna2d1O08532 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacna2d1O08532 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacna2d1O08532 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacna2d1O08532 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacna2d1O08532 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacna2d1O08532 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacna2d1O08532 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cacna2d1O08532 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cacna2d1O08532 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cacna2d1O08532 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cacna2d1O08532 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cacna2d1O08532 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cacna2d1O08532 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacna2d1O08532 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacna2d1O08532 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacna2d1O08532 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacna2d1O08532 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cacna2d1O08532 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cacna2d1O08532 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cacna2d1O08532 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cacna2d1O08532 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cacna2d1O08532 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacna2d1O08532 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacna2d1O08532 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacna2d1O08532 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cacna2d1O08532 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacna2d1O08532 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacna2d1O08532 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacna2d1O08532 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacna2d1O08532 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacna2d1O08532 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacna2d1O08532 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacna2d1O08532 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacna2d1O08532 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cacna2d1O08532 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cacna2d1O08532 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cacna2d1O08532 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cacna2d1O08532 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cacna2d1O08532 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cacna2d1O08532 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cacna2d1O08532 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cacna2d1O08532 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cacna2d1O08532 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cacna2d1O08532 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Cacna2d1O08532 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cacna2d1O08532 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cacna2d1O08532 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cacna2d1O08532 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cacna2d1O08532 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cacna2d1O08532 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cacna2d1O08532 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cacna2d1O08532 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cacna2d1O08532 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms