Protein–RNA interactions for Protein: O08529

Capn2, Calpain-2 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn2O08529 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Capn2O08529 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Capn2O08529 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Capn2O08529 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Capn2O08529 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Capn2O08529 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Capn2O08529 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Capn2O08529 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Capn2O08529 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Capn2O08529 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Capn2O08529 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Capn2O08529 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Capn2O08529 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Capn2O08529 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Capn2O08529 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Capn2O08529 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Capn2O08529 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Capn2O08529 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Capn2O08529 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Capn2O08529 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Capn2O08529 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Capn2O08529 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Capn2O08529 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Capn2O08529 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Capn2O08529 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Capn2O08529 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Capn2O08529 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Capn2O08529 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Capn2O08529 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Capn2O08529 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Capn2O08529 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Capn2O08529 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Capn2O08529 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Capn2O08529 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Capn2O08529 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Capn2O08529 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Capn2O08529 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Capn2O08529 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Capn2O08529 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Capn2O08529 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Capn2O08529 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Capn2O08529 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Capn2O08529 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Capn2O08529 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Capn2O08529 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Capn2O08529 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Capn2O08529 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Capn2O08529 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Capn2O08529 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Capn2O08529 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Capn2O08529 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Capn2O08529 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Capn2O08529 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Capn2O08529 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Capn2O08529 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Capn2O08529 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Capn2O08529 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Capn2O08529 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Capn2O08529 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Capn2O08529 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Capn2O08529 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Capn2O08529 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Capn2O08529 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Capn2O08529 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Capn2O08529 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Capn2O08529 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Capn2O08529 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Capn2O08529 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Capn2O08529 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Capn2O08529 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Capn2O08529 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Capn2O08529 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Capn2O08529 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Capn2O08529 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Capn2O08529 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Capn2O08529 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Capn2O08529 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Capn2O08529 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Capn2O08529 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Capn2O08529 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Capn2O08529 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Capn2O08529 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Capn2O08529 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Capn2O08529 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Capn2O08529 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Capn2O08529 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Capn2O08529 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Capn2O08529 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Capn2O08529 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Capn2O08529 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Capn2O08529 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Capn2O08529 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Capn2O08529 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Capn2O08529 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Capn2O08529 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Capn2O08529 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Capn2O08529 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Capn2O08529 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Capn2O08529 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Capn2O08529 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.4 ms