Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Usp35M0QWN7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp35M0QWN7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp35M0QWN7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp35M0QWN7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp35M0QWN7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp35M0QWN7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp35M0QWN7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp35M0QWN7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp35M0QWN7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp35M0QWN7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp35M0QWN7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp35M0QWN7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp35M0QWN7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp35M0QWN7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp35M0QWN7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp35M0QWN7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp35M0QWN7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp35M0QWN7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp35M0QWN7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp35M0QWN7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp35M0QWN7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp35M0QWN7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp35M0QWN7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp35M0QWN7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp35M0QWN7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp35M0QWN7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp35M0QWN7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp35M0QWN7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp35M0QWN7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp35M0QWN7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp35M0QWN7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp35M0QWN7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp35M0QWN7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp35M0QWN7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp35M0QWN7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp35M0QWN7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp35M0QWN7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp35M0QWN7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp35M0QWN7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp35M0QWN7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp35M0QWN7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp35M0QWN7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp35M0QWN7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp35M0QWN7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp35M0QWN7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp35M0QWN7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp35M0QWN7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp35M0QWN7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp35M0QWN7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Usp35M0QWN7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Usp35M0QWN7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Usp35M0QWN7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Usp35M0QWN7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Usp35M0QWN7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp35M0QWN7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp35M0QWN7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp35M0QWN7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp35M0QWN7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp35M0QWN7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp35M0QWN7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp35M0QWN7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp35M0QWN7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp35M0QWN7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp35M0QWN7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp35M0QWN7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp35M0QWN7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp35M0QWN7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp35M0QWN7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp35M0QWN7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp35M0QWN7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp35M0QWN7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp35M0QWN7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp35M0QWN7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp35M0QWN7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp35M0QWN7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp35M0QWN7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp35M0QWN7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp35M0QWN7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp35M0QWN7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp35M0QWN7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp35M0QWN7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp35M0QWN7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp35M0QWN7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp35M0QWN7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp35M0QWN7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp35M0QWN7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp35M0QWN7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp35M0QWN7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp35M0QWN7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp35M0QWN7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp35M0QWN7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp35M0QWN7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp35M0QWN7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp35M0QWN7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp35M0QWN7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp35M0QWN7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp35M0QWN7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp35M0QWN7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Usp35M0QWN7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms