Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm2035J3QP87 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm2035J3QP87 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm2035J3QP87 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm2035J3QP87 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm2035J3QP87 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm2035J3QP87 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm2035J3QP87 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm2035J3QP87 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm2035J3QP87 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm2035J3QP87 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm2035J3QP87 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm2035J3QP87 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm2035J3QP87 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm2035J3QP87 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm2035J3QP87 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm2035J3QP87 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm2035J3QP87 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm2035J3QP87 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm2035J3QP87 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm2035J3QP87 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm2035J3QP87 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm2035J3QP87 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm2035J3QP87 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm2035J3QP87 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm2035J3QP87 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm2035J3QP87 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm2035J3QP87 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm2035J3QP87 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm2035J3QP87 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm2035J3QP87 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm2035J3QP87 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm2035J3QP87 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm2035J3QP87 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm2035J3QP87 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm2035J3QP87 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm2035J3QP87 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm2035J3QP87 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm2035J3QP87 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm2035J3QP87 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm2035J3QP87 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm2035J3QP87 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm2035J3QP87 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm2035J3QP87 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm2035J3QP87 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm2035J3QP87 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm2035J3QP87 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm2035J3QP87 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm2035J3QP87 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm2035J3QP87 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm2035J3QP87 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm2035J3QP87 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm2035J3QP87 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm2035J3QP87 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm2035J3QP87 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm2035J3QP87 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm2035J3QP87 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm2035J3QP87 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm2035J3QP87 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm2035J3QP87 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm2035J3QP87 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm2035J3QP87 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm2035J3QP87 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm2035J3QP87 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm2035J3QP87 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm2035J3QP87 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm2035J3QP87 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm2035J3QP87 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm2035J3QP87 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm2035J3QP87 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm2035J3QP87 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm2035J3QP87 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm2035J3QP87 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm2035J3QP87 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm2035J3QP87 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm2035J3QP87 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm2035J3QP87 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm2035J3QP87 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm2035J3QP87 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm2035J3QP87 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm2035J3QP87 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm2035J3QP87 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm2035J3QP87 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm2035J3QP87 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm2035J3QP87 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm2035J3QP87 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm2035J3QP87 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm2035J3QP87 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gm2035J3QP87 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gm2035J3QP87 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm2035J3QP87 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm2035J3QP87 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm2035J3QP87 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm2035J3QP87 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm2035J3QP87 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm2035J3QP87 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm2035J3QP87 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm2035J3QP87 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm2035J3QP87 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm2035J3QP87 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms