Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20918J3QN17 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20918J3QN17 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20918J3QN17 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20918J3QN17 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20918J3QN17 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20918J3QN17 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20918J3QN17 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20918J3QN17 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20918J3QN17 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20918J3QN17 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20918J3QN17 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20918J3QN17 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20918J3QN17 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20918J3QN17 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20918J3QN17 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20918J3QN17 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20918J3QN17 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20918J3QN17 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20918J3QN17 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20918J3QN17 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20918J3QN17 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20918J3QN17 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20918J3QN17 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20918J3QN17 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20918J3QN17 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20918J3QN17 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20918J3QN17 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20918J3QN17 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20918J3QN17 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20918J3QN17 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20918J3QN17 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20918J3QN17 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20918J3QN17 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20918J3QN17 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20918J3QN17 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20918J3QN17 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20918J3QN17 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20918J3QN17 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20918J3QN17 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20918J3QN17 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20918J3QN17 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20918J3QN17 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20918J3QN17 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20918J3QN17 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20918J3QN17 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20918J3QN17 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20918J3QN17 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20918J3QN17 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20918J3QN17 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20918J3QN17 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20918J3QN17 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20918J3QN17 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm20918J3QN17 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm20918J3QN17 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm20918J3QN17 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm20918J3QN17 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm20918J3QN17 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm20918J3QN17 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm20918J3QN17 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm20918J3QN17 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm20918J3QN17 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm20918J3QN17 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm20918J3QN17 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20918J3QN17 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20918J3QN17 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20918J3QN17 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20918J3QN17 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20918J3QN17 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20918J3QN17 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20918J3QN17 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20918J3QN17 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20918J3QN17 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20918J3QN17 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20918J3QN17 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20918J3QN17 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20918J3QN17 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20918J3QN17 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20918J3QN17 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20918J3QN17 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20918J3QN17 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20918J3QN17 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20918J3QN17 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20918J3QN17 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20918J3QN17 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20918J3QN17 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20918J3QN17 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20918J3QN17 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20918J3QN17 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20918J3QN17 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20918J3QN17 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20918J3QN17 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20918J3QN17 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20918J3QN17 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20918J3QN17 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20918J3QN17 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20918J3QN17 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20918J3QN17 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20918J3QN17 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm20918J3QN17 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 418.5 ms