Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS2

1700014D04Rik, MCG148436, mousemouse

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700014D04RikJ3QMS2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
1700014D04RikJ3QMS2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
1700014D04RikJ3QMS2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
1700014D04RikJ3QMS2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
1700014D04RikJ3QMS2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
1700014D04RikJ3QMS2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
1700014D04RikJ3QMS2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
1700014D04RikJ3QMS2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
1700014D04RikJ3QMS2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
1700014D04RikJ3QMS2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
1700014D04RikJ3QMS2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
1700014D04RikJ3QMS2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
1700014D04RikJ3QMS2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
1700014D04RikJ3QMS2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
1700014D04RikJ3QMS2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
1700014D04RikJ3QMS2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
1700014D04RikJ3QMS2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
1700014D04RikJ3QMS2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
1700014D04RikJ3QMS2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
1700014D04RikJ3QMS2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700014D04RikJ3QMS2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700014D04RikJ3QMS2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700014D04RikJ3QMS2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
1700014D04RikJ3QMS2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
1700014D04RikJ3QMS2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
1700014D04RikJ3QMS2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
1700014D04RikJ3QMS2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700014D04RikJ3QMS2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700014D04RikJ3QMS2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700014D04RikJ3QMS2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700014D04RikJ3QMS2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700014D04RikJ3QMS2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
1700014D04RikJ3QMS2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700014D04RikJ3QMS2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700014D04RikJ3QMS2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700014D04RikJ3QMS2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700014D04RikJ3QMS2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700014D04RikJ3QMS2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700014D04RikJ3QMS2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700014D04RikJ3QMS2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700014D04RikJ3QMS2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700014D04RikJ3QMS2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700014D04RikJ3QMS2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700014D04RikJ3QMS2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700014D04RikJ3QMS2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700014D04RikJ3QMS2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700014D04RikJ3QMS2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700014D04RikJ3QMS2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700014D04RikJ3QMS2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
1700014D04RikJ3QMS2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700014D04RikJ3QMS2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700014D04RikJ3QMS2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700014D04RikJ3QMS2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700014D04RikJ3QMS2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700014D04RikJ3QMS2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700014D04RikJ3QMS2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700014D04RikJ3QMS2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700014D04RikJ3QMS2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700014D04RikJ3QMS2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700014D04RikJ3QMS2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700014D04RikJ3QMS2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700014D04RikJ3QMS2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700014D04RikJ3QMS2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700014D04RikJ3QMS2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700014D04RikJ3QMS2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700014D04RikJ3QMS2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
1700014D04RikJ3QMS2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
1700014D04RikJ3QMS2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
1700014D04RikJ3QMS2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
1700014D04RikJ3QMS2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
1700014D04RikJ3QMS2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
1700014D04RikJ3QMS2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
1700014D04RikJ3QMS2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.32■■□□□ 1
1700014D04RikJ3QMS2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
1700014D04RikJ3QMS2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
1700014D04RikJ3QMS2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
1700014D04RikJ3QMS2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
1700014D04RikJ3QMS2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
1700014D04RikJ3QMS2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.3■■□□□ 1
1700014D04RikJ3QMS2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
1700014D04RikJ3QMS2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
1700014D04RikJ3QMS2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
1700014D04RikJ3QMS2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
1700014D04RikJ3QMS2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
1700014D04RikJ3QMS2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
1700014D04RikJ3QMS2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
1700014D04RikJ3QMS2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.29■■□□□ 1
1700014D04RikJ3QMS2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1700014D04RikJ3QMS2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
1700014D04RikJ3QMS2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1700014D04RikJ3QMS2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
1700014D04RikJ3QMS2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.27■■□□□ 1
1700014D04RikJ3QMS2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
1700014D04RikJ3QMS2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700014D04RikJ3QMS2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700014D04RikJ3QMS2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700014D04RikJ3QMS2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700014D04RikJ3QMS2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
1700014D04RikJ3QMS2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
1700014D04RikJ3QMS2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms