Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
XntrpcF8VQM8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
XntrpcF8VQM8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
XntrpcF8VQM8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
XntrpcF8VQM8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
XntrpcF8VQM8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
XntrpcF8VQM8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
XntrpcF8VQM8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XntrpcF8VQM8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XntrpcF8VQM8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XntrpcF8VQM8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XntrpcF8VQM8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XntrpcF8VQM8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
XntrpcF8VQM8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XntrpcF8VQM8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XntrpcF8VQM8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XntrpcF8VQM8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XntrpcF8VQM8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XntrpcF8VQM8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
XntrpcF8VQM8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
XntrpcF8VQM8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XntrpcF8VQM8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XntrpcF8VQM8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XntrpcF8VQM8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XntrpcF8VQM8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XntrpcF8VQM8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XntrpcF8VQM8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
XntrpcF8VQM8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XntrpcF8VQM8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XntrpcF8VQM8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XntrpcF8VQM8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XntrpcF8VQM8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
XntrpcF8VQM8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
XntrpcF8VQM8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
XntrpcF8VQM8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
XntrpcF8VQM8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
XntrpcF8VQM8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XntrpcF8VQM8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
XntrpcF8VQM8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XntrpcF8VQM8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XntrpcF8VQM8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
XntrpcF8VQM8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
XntrpcF8VQM8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XntrpcF8VQM8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XntrpcF8VQM8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XntrpcF8VQM8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XntrpcF8VQM8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
XntrpcF8VQM8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
XntrpcF8VQM8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
XntrpcF8VQM8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
XntrpcF8VQM8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XntrpcF8VQM8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XntrpcF8VQM8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XntrpcF8VQM8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XntrpcF8VQM8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XntrpcF8VQM8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XntrpcF8VQM8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XntrpcF8VQM8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XntrpcF8VQM8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XntrpcF8VQM8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XntrpcF8VQM8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
XntrpcF8VQM8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XntrpcF8VQM8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XntrpcF8VQM8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XntrpcF8VQM8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XntrpcF8VQM8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XntrpcF8VQM8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XntrpcF8VQM8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XntrpcF8VQM8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
XntrpcF8VQM8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
XntrpcF8VQM8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
XntrpcF8VQM8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XntrpcF8VQM8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XntrpcF8VQM8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
XntrpcF8VQM8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
XntrpcF8VQM8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XntrpcF8VQM8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
XntrpcF8VQM8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
XntrpcF8VQM8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XntrpcF8VQM8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XntrpcF8VQM8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XntrpcF8VQM8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
XntrpcF8VQM8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XntrpcF8VQM8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XntrpcF8VQM8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XntrpcF8VQM8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
XntrpcF8VQM8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
XntrpcF8VQM8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
XntrpcF8VQM8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
XntrpcF8VQM8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
XntrpcF8VQM8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
XntrpcF8VQM8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
XntrpcF8VQM8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
XntrpcF8VQM8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
XntrpcF8VQM8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
XntrpcF8VQM8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
XntrpcF8VQM8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XntrpcF8VQM8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
XntrpcF8VQM8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XntrpcF8VQM8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151.8 ms