Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm10378F6XQQ1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm10378F6XQQ1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm10378F6XQQ1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm10378F6XQQ1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm10378F6XQQ1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm10378F6XQQ1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm10378F6XQQ1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm10378F6XQQ1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm10378F6XQQ1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm10378F6XQQ1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm10378F6XQQ1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm10378F6XQQ1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm10378F6XQQ1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm10378F6XQQ1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm10378F6XQQ1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm10378F6XQQ1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm10378F6XQQ1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm10378F6XQQ1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm10378F6XQQ1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm10378F6XQQ1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm10378F6XQQ1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm10378F6XQQ1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm10378F6XQQ1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm10378F6XQQ1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm10378F6XQQ1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm10378F6XQQ1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm10378F6XQQ1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm10378F6XQQ1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm10378F6XQQ1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm10378F6XQQ1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm10378F6XQQ1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm10378F6XQQ1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm10378F6XQQ1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm10378F6XQQ1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm10378F6XQQ1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm10378F6XQQ1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm10378F6XQQ1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm10378F6XQQ1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm10378F6XQQ1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm10378F6XQQ1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm10378F6XQQ1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm10378F6XQQ1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm10378F6XQQ1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm10378F6XQQ1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm10378F6XQQ1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm10378F6XQQ1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm10378F6XQQ1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm10378F6XQQ1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm10378F6XQQ1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm10378F6XQQ1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm10378F6XQQ1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm10378F6XQQ1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm10378F6XQQ1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm10378F6XQQ1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm10378F6XQQ1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm10378F6XQQ1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm10378F6XQQ1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm10378F6XQQ1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm10378F6XQQ1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm10378F6XQQ1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm10378F6XQQ1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm10378F6XQQ1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm10378F6XQQ1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm10378F6XQQ1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm10378F6XQQ1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm10378F6XQQ1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm10378F6XQQ1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm10378F6XQQ1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm10378F6XQQ1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm10378F6XQQ1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm10378F6XQQ1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm10378F6XQQ1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm10378F6XQQ1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm10378F6XQQ1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm10378F6XQQ1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm10378F6XQQ1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm10378F6XQQ1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm10378F6XQQ1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm10378F6XQQ1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm10378F6XQQ1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm10378F6XQQ1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm10378F6XQQ1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm10378F6XQQ1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm10378F6XQQ1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm10378F6XQQ1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm10378F6XQQ1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm10378F6XQQ1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm10378F6XQQ1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm10378F6XQQ1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm10378F6XQQ1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm10378F6XQQ1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm10378F6XQQ1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm10378F6XQQ1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm10378F6XQQ1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm10378F6XQQ1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm10378F6XQQ1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm10378F6XQQ1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gm10378F6XQQ1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm10378F6XQQ1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.8 ms