Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm28305F6U473 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm28305F6U473 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm28305F6U473 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm28305F6U473 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm28305F6U473 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm28305F6U473 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm28305F6U473 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm28305F6U473 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm28305F6U473 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm28305F6U473 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm28305F6U473 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm28305F6U473 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm28305F6U473 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm28305F6U473 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm28305F6U473 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm28305F6U473 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm28305F6U473 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm28305F6U473 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28305F6U473 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28305F6U473 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28305F6U473 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28305F6U473 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28305F6U473 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28305F6U473 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28305F6U473 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28305F6U473 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28305F6U473 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm28305F6U473 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm28305F6U473 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm28305F6U473 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm28305F6U473 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm28305F6U473 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm28305F6U473 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm28305F6U473 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm28305F6U473 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm28305F6U473 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm28305F6U473 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm28305F6U473 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm28305F6U473 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm28305F6U473 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm28305F6U473 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm28305F6U473 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm28305F6U473 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm28305F6U473 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm28305F6U473 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm28305F6U473 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm28305F6U473 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm28305F6U473 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28305F6U473 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28305F6U473 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28305F6U473 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28305F6U473 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28305F6U473 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28305F6U473 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28305F6U473 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28305F6U473 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28305F6U473 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28305F6U473 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28305F6U473 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28305F6U473 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28305F6U473 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28305F6U473 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm28305F6U473 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm28305F6U473 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm28305F6U473 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm28305F6U473 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm28305F6U473 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm28305F6U473 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm28305F6U473 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm28305F6U473 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm28305F6U473 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm28305F6U473 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm28305F6U473 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm28305F6U473 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28305F6U473 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28305F6U473 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28305F6U473 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28305F6U473 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28305F6U473 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28305F6U473 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28305F6U473 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm28305F6U473 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm28305F6U473 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm28305F6U473 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm28305F6U473 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm28305F6U473 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm28305F6U473 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm28305F6U473 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm28305F6U473 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm28305F6U473 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm28305F6U473 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm28305F6U473 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm28305F6U473 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm28305F6U473 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm28305F6U473 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm28305F6U473 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm28305F6U473 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm28305F6U473 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm28305F6U473 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms