Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc74aE9Q9U8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc74aE9Q9U8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc74aE9Q9U8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc74aE9Q9U8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc74aE9Q9U8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc74aE9Q9U8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc74aE9Q9U8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc74aE9Q9U8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc74aE9Q9U8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc74aE9Q9U8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc74aE9Q9U8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc74aE9Q9U8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc74aE9Q9U8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc74aE9Q9U8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc74aE9Q9U8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc74aE9Q9U8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc74aE9Q9U8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc74aE9Q9U8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc74aE9Q9U8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc74aE9Q9U8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc74aE9Q9U8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc74aE9Q9U8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc74aE9Q9U8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc74aE9Q9U8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc74aE9Q9U8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc74aE9Q9U8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc74aE9Q9U8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc74aE9Q9U8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc74aE9Q9U8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc74aE9Q9U8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc74aE9Q9U8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc74aE9Q9U8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc74aE9Q9U8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc74aE9Q9U8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc74aE9Q9U8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc74aE9Q9U8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc74aE9Q9U8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc74aE9Q9U8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc74aE9Q9U8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc74aE9Q9U8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc74aE9Q9U8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc74aE9Q9U8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc74aE9Q9U8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc74aE9Q9U8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc74aE9Q9U8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc74aE9Q9U8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc74aE9Q9U8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc74aE9Q9U8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc74aE9Q9U8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc74aE9Q9U8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc74aE9Q9U8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc74aE9Q9U8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc74aE9Q9U8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc74aE9Q9U8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc74aE9Q9U8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc74aE9Q9U8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc74aE9Q9U8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc74aE9Q9U8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc74aE9Q9U8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc74aE9Q9U8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc74aE9Q9U8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc74aE9Q9U8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc74aE9Q9U8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc74aE9Q9U8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc74aE9Q9U8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc74aE9Q9U8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc74aE9Q9U8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc74aE9Q9U8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc74aE9Q9U8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc74aE9Q9U8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc74aE9Q9U8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc74aE9Q9U8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc74aE9Q9U8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc74aE9Q9U8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc74aE9Q9U8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc74aE9Q9U8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc74aE9Q9U8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc74aE9Q9U8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc74aE9Q9U8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc74aE9Q9U8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc74aE9Q9U8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc74aE9Q9U8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc74aE9Q9U8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc74aE9Q9U8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc74aE9Q9U8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc74aE9Q9U8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc74aE9Q9U8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc74aE9Q9U8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc74aE9Q9U8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc74aE9Q9U8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc74aE9Q9U8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc74aE9Q9U8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc74aE9Q9U8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc74aE9Q9U8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc74aE9Q9U8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc74aE9Q9U8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc74aE9Q9U8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms