Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
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Rdh16f1E9Q9P8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rdh16f1E9Q9P8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rdh16f1E9Q9P8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rdh16f1E9Q9P8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rdh16f1E9Q9P8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rdh16f1E9Q9P8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Rdh16f1E9Q9P8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rdh16f1E9Q9P8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
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Rdh16f1E9Q9P8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rdh16f1E9Q9P8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rdh16f1E9Q9P8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rdh16f1E9Q9P8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rdh16f1E9Q9P8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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Rdh16f1E9Q9P8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rdh16f1E9Q9P8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rdh16f1E9Q9P8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Rdh16f1E9Q9P8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rdh16f1E9Q9P8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rdh16f1E9Q9P8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rdh16f1E9Q9P8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rdh16f1E9Q9P8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Rdh16f1E9Q9P8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rdh16f1E9Q9P8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rdh16f1E9Q9P8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rdh16f1E9Q9P8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Rdh16f1E9Q9P8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rdh16f1E9Q9P8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rdh16f1E9Q9P8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Rdh16f1E9Q9P8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Rdh16f1E9Q9P8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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