Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7U8

Vmn2r35, Vomeronasal 2, receptor 35, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r35E9Q7U8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn2r35E9Q7U8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn2r35E9Q7U8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vmn2r35E9Q7U8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vmn2r35E9Q7U8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vmn2r35E9Q7U8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vmn2r35E9Q7U8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vmn2r35E9Q7U8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vmn2r35E9Q7U8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vmn2r35E9Q7U8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmn2r35E9Q7U8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn2r35E9Q7U8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn2r35E9Q7U8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn2r35E9Q7U8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn2r35E9Q7U8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn2r35E9Q7U8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn2r35E9Q7U8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn2r35E9Q7U8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn2r35E9Q7U8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn2r35E9Q7U8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn2r35E9Q7U8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Vmn2r35E9Q7U8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn2r35E9Q7U8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn2r35E9Q7U8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn2r35E9Q7U8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn2r35E9Q7U8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn2r35E9Q7U8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn2r35E9Q7U8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn2r35E9Q7U8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn2r35E9Q7U8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn2r35E9Q7U8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn2r35E9Q7U8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn2r35E9Q7U8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn2r35E9Q7U8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn2r35E9Q7U8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn2r35E9Q7U8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn2r35E9Q7U8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn2r35E9Q7U8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn2r35E9Q7U8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn2r35E9Q7U8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn2r35E9Q7U8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn2r35E9Q7U8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn2r35E9Q7U8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Vmn2r35E9Q7U8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn2r35E9Q7U8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn2r35E9Q7U8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn2r35E9Q7U8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn2r35E9Q7U8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn2r35E9Q7U8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn2r35E9Q7U8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn2r35E9Q7U8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn2r35E9Q7U8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn2r35E9Q7U8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn2r35E9Q7U8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn2r35E9Q7U8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn2r35E9Q7U8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn2r35E9Q7U8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn2r35E9Q7U8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn2r35E9Q7U8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn2r35E9Q7U8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn2r35E9Q7U8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn2r35E9Q7U8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn2r35E9Q7U8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn2r35E9Q7U8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn2r35E9Q7U8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn2r35E9Q7U8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn2r35E9Q7U8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn2r35E9Q7U8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn2r35E9Q7U8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn2r35E9Q7U8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn2r35E9Q7U8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn2r35E9Q7U8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn2r35E9Q7U8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn2r35E9Q7U8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn2r35E9Q7U8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn2r35E9Q7U8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn2r35E9Q7U8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn2r35E9Q7U8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn2r35E9Q7U8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn2r35E9Q7U8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn2r35E9Q7U8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn2r35E9Q7U8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn2r35E9Q7U8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn2r35E9Q7U8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn2r35E9Q7U8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn2r35E9Q7U8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn2r35E9Q7U8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn2r35E9Q7U8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn2r35E9Q7U8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn2r35E9Q7U8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn2r35E9Q7U8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn2r35E9Q7U8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn2r35E9Q7U8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn2r35E9Q7U8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn2r35E9Q7U8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn2r35E9Q7U8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn2r35E9Q7U8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn2r35E9Q7U8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn2r35E9Q7U8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn2r35E9Q7U8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms