Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ApobE9Q414 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ApobE9Q414 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ApobE9Q414 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ApobE9Q414 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ApobE9Q414 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ApobE9Q414 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ApobE9Q414 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ApobE9Q414 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ApobE9Q414 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ApobE9Q414 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ApobE9Q414 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ApobE9Q414 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ApobE9Q414 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ApobE9Q414 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ApobE9Q414 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ApobE9Q414 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ApobE9Q414 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ApobE9Q414 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ApobE9Q414 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ApobE9Q414 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ApobE9Q414 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ApobE9Q414 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ApobE9Q414 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ApobE9Q414 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ApobE9Q414 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ApobE9Q414 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ApobE9Q414 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ApobE9Q414 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ApobE9Q414 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ApobE9Q414 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ApobE9Q414 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ApobE9Q414 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ApobE9Q414 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ApobE9Q414 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ApobE9Q414 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ApobE9Q414 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ApobE9Q414 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ApobE9Q414 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ApobE9Q414 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ApobE9Q414 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ApobE9Q414 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ApobE9Q414 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ApobE9Q414 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ApobE9Q414 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ApobE9Q414 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ApobE9Q414 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ApobE9Q414 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ApobE9Q414 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ApobE9Q414 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ApobE9Q414 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ApobE9Q414 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ApobE9Q414 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ApobE9Q414 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ApobE9Q414 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
ApobE9Q414 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ApobE9Q414 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ApobE9Q414 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ApobE9Q414 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ApobE9Q414 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ApobE9Q414 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ApobE9Q414 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ApobE9Q414 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ApobE9Q414 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ApobE9Q414 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ApobE9Q414 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ApobE9Q414 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ApobE9Q414 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ApobE9Q414 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ApobE9Q414 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ApobE9Q414 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ApobE9Q414 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ApobE9Q414 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ApobE9Q414 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ApobE9Q414 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ApobE9Q414 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ApobE9Q414 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ApobE9Q414 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ApobE9Q414 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ApobE9Q414 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ApobE9Q414 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ApobE9Q414 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ApobE9Q414 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ApobE9Q414 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ApobE9Q414 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ApobE9Q414 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ApobE9Q414 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ApobE9Q414 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ApobE9Q414 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ApobE9Q414 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ApobE9Q414 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ApobE9Q414 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ApobE9Q414 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ApobE9Q414 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ApobE9Q414 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ApobE9Q414 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ApobE9Q414 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ApobE9Q414 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ApobE9Q414 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ApobE9Q414 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 180.4 ms