Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Susd1E9Q3H4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Susd1E9Q3H4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Susd1E9Q3H4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Susd1E9Q3H4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Susd1E9Q3H4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Susd1E9Q3H4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Susd1E9Q3H4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Susd1E9Q3H4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Susd1E9Q3H4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Susd1E9Q3H4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Susd1E9Q3H4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Susd1E9Q3H4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Susd1E9Q3H4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Susd1E9Q3H4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Susd1E9Q3H4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Susd1E9Q3H4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Susd1E9Q3H4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Susd1E9Q3H4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Susd1E9Q3H4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Susd1E9Q3H4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Susd1E9Q3H4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Susd1E9Q3H4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Susd1E9Q3H4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Susd1E9Q3H4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Susd1E9Q3H4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Susd1E9Q3H4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Susd1E9Q3H4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Susd1E9Q3H4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Susd1E9Q3H4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Susd1E9Q3H4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Susd1E9Q3H4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Susd1E9Q3H4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Susd1E9Q3H4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Susd1E9Q3H4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Susd1E9Q3H4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Susd1E9Q3H4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Susd1E9Q3H4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Susd1E9Q3H4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Susd1E9Q3H4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Susd1E9Q3H4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Susd1E9Q3H4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Susd1E9Q3H4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Susd1E9Q3H4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Susd1E9Q3H4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Susd1E9Q3H4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Susd1E9Q3H4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Susd1E9Q3H4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Susd1E9Q3H4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Susd1E9Q3H4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Susd1E9Q3H4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Susd1E9Q3H4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Susd1E9Q3H4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Susd1E9Q3H4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Susd1E9Q3H4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Susd1E9Q3H4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Susd1E9Q3H4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Susd1E9Q3H4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Susd1E9Q3H4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Susd1E9Q3H4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Susd1E9Q3H4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Susd1E9Q3H4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Susd1E9Q3H4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Susd1E9Q3H4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Susd1E9Q3H4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Susd1E9Q3H4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Susd1E9Q3H4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Susd1E9Q3H4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Susd1E9Q3H4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Susd1E9Q3H4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Susd1E9Q3H4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Susd1E9Q3H4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Susd1E9Q3H4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Susd1E9Q3H4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Susd1E9Q3H4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Susd1E9Q3H4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Susd1E9Q3H4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Susd1E9Q3H4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Susd1E9Q3H4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Susd1E9Q3H4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Susd1E9Q3H4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Susd1E9Q3H4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Susd1E9Q3H4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Susd1E9Q3H4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Susd1E9Q3H4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Susd1E9Q3H4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Susd1E9Q3H4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Susd1E9Q3H4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Susd1E9Q3H4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Susd1E9Q3H4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Susd1E9Q3H4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Susd1E9Q3H4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Susd1E9Q3H4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Susd1E9Q3H4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Susd1E9Q3H4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Susd1E9Q3H4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Susd1E9Q3H4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Susd1E9Q3H4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Susd1E9Q3H4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Susd1E9Q3H4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms