Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r238E9Q373 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r238E9Q373 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r238E9Q373 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r238E9Q373 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r238E9Q373 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r238E9Q373 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r238E9Q373 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r238E9Q373 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn1r238E9Q373 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn1r238E9Q373 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn1r238E9Q373 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn1r238E9Q373 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn1r238E9Q373 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn1r238E9Q373 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn1r238E9Q373 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r238E9Q373 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r238E9Q373 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r238E9Q373 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r238E9Q373 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r238E9Q373 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r238E9Q373 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r238E9Q373 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r238E9Q373 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r238E9Q373 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r238E9Q373 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r238E9Q373 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r238E9Q373 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r238E9Q373 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r238E9Q373 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r238E9Q373 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r238E9Q373 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r238E9Q373 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r238E9Q373 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r238E9Q373 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r238E9Q373 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r238E9Q373 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r238E9Q373 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r238E9Q373 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r238E9Q373 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r238E9Q373 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r238E9Q373 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r238E9Q373 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r238E9Q373 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r238E9Q373 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r238E9Q373 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r238E9Q373 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r238E9Q373 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r238E9Q373 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r238E9Q373 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r238E9Q373 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r238E9Q373 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r238E9Q373 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r238E9Q373 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r238E9Q373 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r238E9Q373 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r238E9Q373 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r238E9Q373 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r238E9Q373 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r238E9Q373 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r238E9Q373 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r238E9Q373 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r238E9Q373 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r238E9Q373 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r238E9Q373 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r238E9Q373 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r238E9Q373 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r238E9Q373 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r238E9Q373 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r238E9Q373 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r238E9Q373 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r238E9Q373 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r238E9Q373 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r238E9Q373 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r238E9Q373 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r238E9Q373 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r238E9Q373 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r238E9Q373 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r238E9Q373 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vmn1r238E9Q373 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vmn1r238E9Q373 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn1r238E9Q373 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn1r238E9Q373 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn1r238E9Q373 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn1r238E9Q373 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn1r238E9Q373 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn1r238E9Q373 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r238E9Q373 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r238E9Q373 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r238E9Q373 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r238E9Q373 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r238E9Q373 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r238E9Q373 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r238E9Q373 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r238E9Q373 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn1r238E9Q373 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn1r238E9Q373 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn1r238E9Q373 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn1r238E9Q373 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r238E9Q373 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms