Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2Z4

Gm16494, Predicted gene 16494, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16494E9Q2Z4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,34■■□□□ 1,17
Gm16494E9Q2Z4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22,33■■□□□ 1,17
Gm16494E9Q2Z4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,33■■□□□ 1,17
Gm16494E9Q2Z4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22,33■■□□□ 1,17
Gm16494E9Q2Z4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22,33■■□□□ 1,17
Gm16494E9Q2Z4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,33■■□□□ 1,17
Gm16494E9Q2Z4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22,33■■□□□ 1,16
Gm16494E9Q2Z4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22,32■■□□□ 1,16
Gm16494E9Q2Z4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22,32■■□□□ 1,16
Gm16494E9Q2Z4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,32■■□□□ 1,16
Gm16494E9Q2Z4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,32■■□□□ 1,16
Gm16494E9Q2Z4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,31■■□□□ 1,16
Gm16494E9Q2Z4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22,31■■□□□ 1,16
Gm16494E9Q2Z4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22,31■■□□□ 1,16
Gm16494E9Q2Z4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,3■■□□□ 1,16
Gm16494E9Q2Z4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22,3■■□□□ 1,16
Gm16494E9Q2Z4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22,3■■□□□ 1,16
Gm16494E9Q2Z4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,3■■□□□ 1,16
Gm16494E9Q2Z4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,29■■□□□ 1,16
Gm16494E9Q2Z4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,29■■□□□ 1,16
Gm16494E9Q2Z4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22,29■■□□□ 1,16
Gm16494E9Q2Z4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,28■■□□□ 1,16
Gm16494E9Q2Z4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22,28■■□□□ 1,16
Gm16494E9Q2Z4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22,28■■□□□ 1,16
Gm16494E9Q2Z4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22,27■■□□□ 1,16
Gm16494E9Q2Z4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,27■■□□□ 1,16
Gm16494E9Q2Z4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
Gm16494E9Q2Z4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
Gm16494E9Q2Z4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
Gm16494E9Q2Z4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
Gm16494E9Q2Z4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22,26■■□□□ 1,15
Gm16494E9Q2Z4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
Gm16494E9Q2Z4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
Gm16494E9Q2Z4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,25■■□□□ 1,15
Gm16494E9Q2Z4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,25■■□□□ 1,15
Gm16494E9Q2Z4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22,25■■□□□ 1,15
Gm16494E9Q2Z4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22,24■■□□□ 1,15
Gm16494E9Q2Z4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,24■■□□□ 1,15
Gm16494E9Q2Z4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,24■■□□□ 1,15
Gm16494E9Q2Z4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22,23■■□□□ 1,15
Gm16494E9Q2Z4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22,23■■□□□ 1,15
Gm16494E9Q2Z4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22,23■■□□□ 1,15
Gm16494E9Q2Z4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22,23■■□□□ 1,15
Gm16494E9Q2Z4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,22■■□□□ 1,15
Gm16494E9Q2Z4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,22■■□□□ 1,15
Gm16494E9Q2Z4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,22■■□□□ 1,15
Gm16494E9Q2Z4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,22■■□□□ 1,15
Gm16494E9Q2Z4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22,22■■□□□ 1,15
Gm16494E9Q2Z4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22,21■■□□□ 1,15
Gm16494E9Q2Z4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,21■■□□□ 1,15
Gm16494E9Q2Z4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,21■■□□□ 1,15
Gm16494E9Q2Z4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22,2■■□□□ 1,14
Gm16494E9Q2Z4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22,2■■□□□ 1,14
Gm16494E9Q2Z4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,2■■□□□ 1,14
Gm16494E9Q2Z4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22,19■■□□□ 1,14
Gm16494E9Q2Z4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22,19■■□□□ 1,14
Gm16494E9Q2Z4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22,19■■□□□ 1,14
Gm16494E9Q2Z4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22,18■■□□□ 1,14
Gm16494E9Q2Z4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22,18■■□□□ 1,14
Gm16494E9Q2Z4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22,18■■□□□ 1,14
Gm16494E9Q2Z4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,18■■□□□ 1,14
Gm16494E9Q2Z4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,18■■□□□ 1,14
Gm16494E9Q2Z4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,17■■□□□ 1,14
Gm16494E9Q2Z4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22,17■■□□□ 1,14
Gm16494E9Q2Z4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,17■■□□□ 1,14
Gm16494E9Q2Z4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22,17■■□□□ 1,14
Gm16494E9Q2Z4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,17■■□□□ 1,14
Gm16494E9Q2Z4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,16■■□□□ 1,14
Gm16494E9Q2Z4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,16■■□□□ 1,14
Gm16494E9Q2Z4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,16■■□□□ 1,14
Gm16494E9Q2Z4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,16■■□□□ 1,14
Gm16494E9Q2Z4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,16■■□□□ 1,14
Gm16494E9Q2Z4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22,16■■□□□ 1,14
Gm16494E9Q2Z4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,16■■□□□ 1,14
Gm16494E9Q2Z4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
Gm16494E9Q2Z4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22,15■■□□□ 1,14
Gm16494E9Q2Z4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22,15■■□□□ 1,14
Gm16494E9Q2Z4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
Gm16494E9Q2Z4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
Gm16494E9Q2Z4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
Gm16494E9Q2Z4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22,14■■□□□ 1,14
Gm16494E9Q2Z4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,14■■□□□ 1,14
Gm16494E9Q2Z4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22,14■■□□□ 1,13
Gm16494E9Q2Z4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22,14■■□□□ 1,13
Gm16494E9Q2Z4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,14■■□□□ 1,13
Gm16494E9Q2Z4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
Gm16494E9Q2Z4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
Gm16494E9Q2Z4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
Gm16494E9Q2Z4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22,13■■□□□ 1,13
Gm16494E9Q2Z4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
Gm16494E9Q2Z4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
Gm16494E9Q2Z4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22,12■■□□□ 1,13
Gm16494E9Q2Z4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22,12■■□□□ 1,13
Gm16494E9Q2Z4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22,12■■□□□ 1,13
Gm16494E9Q2Z4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
Gm16494E9Q2Z4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
Gm16494E9Q2Z4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
Gm16494E9Q2Z4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,1■■□□□ 1,13
Gm16494E9Q2Z4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,1■■□□□ 1,13
Gm16494E9Q2Z4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,1■■□□□ 1,13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,6 ms