Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2T4

4930523C07Rik, RIKEN cDNA 4930523C07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930523C07RikE9Q2T4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
4930523C07RikE9Q2T4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
4930523C07RikE9Q2T4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
4930523C07RikE9Q2T4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
4930523C07RikE9Q2T4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
4930523C07RikE9Q2T4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
4930523C07RikE9Q2T4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
4930523C07RikE9Q2T4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
4930523C07RikE9Q2T4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
4930523C07RikE9Q2T4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
4930523C07RikE9Q2T4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
4930523C07RikE9Q2T4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
4930523C07RikE9Q2T4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
4930523C07RikE9Q2T4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
4930523C07RikE9Q2T4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
4930523C07RikE9Q2T4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
4930523C07RikE9Q2T4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
4930523C07RikE9Q2T4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
4930523C07RikE9Q2T4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
4930523C07RikE9Q2T4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
4930523C07RikE9Q2T4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
4930523C07RikE9Q2T4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
4930523C07RikE9Q2T4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
4930523C07RikE9Q2T4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
4930523C07RikE9Q2T4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
4930523C07RikE9Q2T4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
4930523C07RikE9Q2T4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
4930523C07RikE9Q2T4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
4930523C07RikE9Q2T4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
4930523C07RikE9Q2T4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
4930523C07RikE9Q2T4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
4930523C07RikE9Q2T4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
4930523C07RikE9Q2T4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
4930523C07RikE9Q2T4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
4930523C07RikE9Q2T4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
4930523C07RikE9Q2T4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
4930523C07RikE9Q2T4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
4930523C07RikE9Q2T4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
4930523C07RikE9Q2T4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
4930523C07RikE9Q2T4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
4930523C07RikE9Q2T4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
4930523C07RikE9Q2T4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
4930523C07RikE9Q2T4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
4930523C07RikE9Q2T4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
4930523C07RikE9Q2T4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
4930523C07RikE9Q2T4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
4930523C07RikE9Q2T4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
4930523C07RikE9Q2T4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
4930523C07RikE9Q2T4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
4930523C07RikE9Q2T4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
4930523C07RikE9Q2T4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
4930523C07RikE9Q2T4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
4930523C07RikE9Q2T4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
4930523C07RikE9Q2T4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
4930523C07RikE9Q2T4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
4930523C07RikE9Q2T4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
4930523C07RikE9Q2T4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
4930523C07RikE9Q2T4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
4930523C07RikE9Q2T4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
4930523C07RikE9Q2T4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
4930523C07RikE9Q2T4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
4930523C07RikE9Q2T4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
4930523C07RikE9Q2T4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
4930523C07RikE9Q2T4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
4930523C07RikE9Q2T4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
4930523C07RikE9Q2T4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
4930523C07RikE9Q2T4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
4930523C07RikE9Q2T4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
4930523C07RikE9Q2T4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
4930523C07RikE9Q2T4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
4930523C07RikE9Q2T4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
4930523C07RikE9Q2T4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
4930523C07RikE9Q2T4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
4930523C07RikE9Q2T4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
4930523C07RikE9Q2T4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
4930523C07RikE9Q2T4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
4930523C07RikE9Q2T4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
4930523C07RikE9Q2T4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
4930523C07RikE9Q2T4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
4930523C07RikE9Q2T4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
4930523C07RikE9Q2T4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
4930523C07RikE9Q2T4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
4930523C07RikE9Q2T4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
4930523C07RikE9Q2T4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
4930523C07RikE9Q2T4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
4930523C07RikE9Q2T4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
4930523C07RikE9Q2T4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
4930523C07RikE9Q2T4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
4930523C07RikE9Q2T4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
4930523C07RikE9Q2T4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
4930523C07RikE9Q2T4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
4930523C07RikE9Q2T4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
4930523C07RikE9Q2T4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
4930523C07RikE9Q2T4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
4930523C07RikE9Q2T4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
4930523C07RikE9Q2T4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
4930523C07RikE9Q2T4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
4930523C07RikE9Q2T4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
4930523C07RikE9Q2T4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
4930523C07RikE9Q2T4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms